地理分布
良渚古城的南面和北面都是天目山脉的支脉，南北与山的距离大致相等，东苕溪和良渚港分别由城的南北两侧向东流过，凤山和雉山两个自然的小山，分别被利用到城墙的西南角和东北角，因此，专家推断，古人在建城时显然对地理位置经过精心勘察和规划。
良渚文化的分布主要在太湖流域和钱塘江流域，包括余杭良渚，还有嘉兴南、上海东、苏州、常州、绍兴、宁波一带;再往外，还有扩张区，西到安徽、江西，往北一直到江苏北部，接近山东，曾经良渚人为了占领这里，还打了一仗;再往外，还有影响区，一直到山西南部地带。当时“良渚”势力占据了半个中国，如果没有较高的经济文化水平，是不可能做到的。考古专家认为良渚古城其实就是“良渚古国”。良渚古城的发现，有人认为中国的朝代的断代应从此改写——由现在认为的最早朝代为夏、商、周，改成良渚。
代表遗址
良渚遗址
良渚位于杭州城北18公里处余杭区良渚镇。发现于1936年，是新石器时代晚期人类聚居的地方。出土的石器有镰、镞、矛、穿孔斧、穿孔刀等，磨制精致，特别是石犁和耘田器的使用，说明当时已进入犁耕阶段。距今5300~4000年的良渚遗址区内有一座面积290万平方米的古城，其年代不晚于良渚文化晚期。考古学家指出，这是长江中下游地区首次发现的良渚文化时期的城址，也是至今所发现的同时代中国最大的城址。当时“良渚”势力占据了半个中国，新发现的这座古城，相当于良渚时的首都。
有专家认为中国朝代的断代应从此改写：由现在认为的最早朝代为夏、商、周，改成良渚。
这座古城东西长约1500～1700米，南北长约1800～1900米，略呈圆角长方形，正南北方向。城墙部分地段残高4米多，做法考究：底部先垫石块，宽度达40～60米(我国现存最完整的古代城垣——明朝洪武年间建造的西安古城墙，底宽18米，顶宽15米)，上面堆筑纯净的黄土，夯实。
西城墙全长约1000米，宽约40～60米，南连凤山，北接东苕溪;接下来，南城墙、北城墙和东城墙依次被发现，同样是底部铺垫石头、大量黄土夯筑;城墙环绕着中间的莫角山遗址。与西城墙相比，其他三面城墙相对更考究：铺垫的石头尖锐很多，明显是人工开凿;城墙外侧石头相对大点，越往里越小;堆筑的黄土层中，有时会掺加一层黑色的黏土层，增加了城墙防水能力。考古人员推测，这些痕迹说明古人最先造的是西城墙，等到建其他三面城墙，经验更丰富了。已经发现的良渚遗址，从其位置、布局和构造来看，专家认为当时有宫殿，生活着王和贵族，如今又找到了城墙，相当于良渚时的首都。
莫角山遗址
莫角山遗址是良渚文化遗址中最大的遗址，位于今杭州市西北25公里，该遗址的中心土墩平面呈东西向的长方形，东西长约670米，南北宽约450米，总面积约30万平方米，土层厚达10.2米。大土台上还有三个小的土墩，呈三足鼎立之势：南为乌龟山，北为小莫角山，东为大莫角山，整个人工堆建的巨大土墩台基形同一座所谓的“土筑金字塔”。而在这个大土台上，现已发现有大片的夯筑基址和大型柱洞遗迹，是当年大型建筑的遗迹。而紧邻莫角山遗址西北的就是反山遗址墓葬群这一所谓的“良渚王陵”。
此外，在“莫角山遗址”之外的太湖周边地区，还分布着“青浦福泉山遗址”(残留之人工土墩东西长94米，南北宽84米，高7.5米)、“武进寺墩遗址”(残留之人工土墩高约20米，直径约100米，遗址总面积90万平方米)等诸多建有所谓“土墩金字塔”的大型聚落遗址，而这些以“土墩金字塔”为其特色的中心聚落或日“没有经典城墙的城市”则连同其附近的中小聚落一起构成了4 800一4 500年前整个东亚大陆上聚落密度和人口密度都最高的古文明区。在这个遗址群中，今人也同样发现了类似“大汶口陶尊文字”的所谓“良渚文字”，以及各种体现了复杂逻辑思维能力的繁缛神秘之抽象图案。对于这么一个远在西元前3千纪前期就已经拥有了原始文字、原始城市和超高密度人口的古聚落群而言，其当初的“主人”究竟是谁，这究竟是一支脱离于中国历史之外的“史前文明”，还是一支真正属于中国历史之有机组成部分的“中国文明”?显然，鉴于前例已经证明，“地名干支密码”对“前龙山时代”的“九黎”地区同样适用，我们是不难就此直接找到答案的。事实上，无论是从今天仍被印在地图上的震泽、漕湖等该地区附近的现代地名来看，还是从各种古地理文献记载的具匾泽、踌陂、苞山、御儿、楱李城、句章等该地区附近的古地名来看，这个著名的良渚文化“古国”之主人无疑应该就是一个以中国“十二地支星神”之第一位“陬(子)”为其守护神的古老九黎语部族。
反山遗址
良渚文化时期的“王陵”——反山遗址。反山遗址位于良渚遗址的偏西部的中心地区，其东南就是著名的莫角山超巨型中心基址，其余都是低洼的农田。反山的海拔高度约10米，东西长90米，南北宽30米，总面积约3000平方米，高出地表约4米。早在20世纪60年代末“深挖洞”的高潮中，当地村民曾在反山南部挖了两个小型防空洞，其中偏西的一个出土了不少石器、玉器等，另一防空洞距反山最重要的大墓——反山12号墓南端仅50厘米。1985年，原长命乡(现属瓶窑镇)一企业的厂址选中了反山，厂区北围墙建在反山顶部北缘，浙江省文物考古研究所在得知这一信息后，于1986年5月8日正式进驻考古工地，次日便开始了考古发掘。
塘山遗址
良渚文化时期的“西险大塘”——塘山遗址。塘山遗址位于良渚遗址的西北侧，是一条东西向的土垣，全长约6.5公里，宽度约在5卜70米，高约3-5米不等。从1996年底到2002年，浙江省文物考古研究所对塘山卢村段和猫耳弄段进行了多次试掘。1996年底首先在卢村段进行了试掘，在30平方米的探沟内发现了玉器残件和石质加工工具。1997年4-6月，义在卢村和猫耳弄段进行试掘。卢村段揭露面积100平方米，探明良渚文化堆积被战国层叠压，在良渚文化层堆积内出土了100多件石质制玉工具、玉料和玉器半成品，清理良渚文化显贵者墓葬2座。