乾符五年(878年)正月初一，义军攻占罗城。山南东道节度使李福率兵来救，败义军于荆门。王仙芝解围而去，到申州(治今河南信阳)东又被招讨副使曾元裕击败，义军损失2万。这时，唐王朝以宋威“杀尚君长非是”，镇压起义“无功”，解除其兵权，擢升曾元裕为招讨使，颍州刺史张自勉为招讨副使，又调西川节度使高骈任荆南节度使兼盐铁运转使，集中优势兵力，加紧围剿王仙芝。
乾符五年(878年)二月，王仙芝义军被曾元裕包围于黄梅(今湖北黄梅西北)，经过无数场激烈的战斗，义军5万余人英勇牺牲，并且在突围中王仙芝不幸战死。余部渡江转战江南，另一部由尚让率领投奔黄巢继续战斗。
正面
王仙芝起义是中国古代历史上一次重要的农民起义运动，极大地打击了唐朝封建政府的腐朽统治，推动了历史的向前发展，影响深远，其后续的黄巢起义更是迫使唐朝政府退随到了四川，直接打击了封建最高统治者。
作为这次农民起义的主要领导者的王仙芝，集中体现了中国古代农民阶级的特质和宝贵品质，既具有革命性，又具有软弱、妥协和局限性;既敢于反抗剥削，又对地主阶级抱有幻想。回顾王仙芝起义的整个过程，从起义开始到战死，三年之间。
负面
王仙芝提出“平均”口号，对动员农民起而反抗唐朝黑暗统治具有很大推动作用，这是中国古代农民阶级的革命性与反抗性的集中体现，值得赞扬，但是在胜利面前经不住考验，在失败面前经不住打击，一再向地主阶级乞降、退让，削弱了起义力量，分裂了革命阵营，导致了对敌斗争的失败，不能不说他的失败，是中国古代农民阶级的阶级局限性的必然结果。但是，在当时的历史条件下，农民阶级很好地完成了历史所赋予的任务，只是因为封建小农经济完全依赖于土地等生产资料，而土地等生产资料又是属于地主阶级所有，才致使封建小农对地主阶级产生妥协、退让的心理，才使他们不敢完全地打破封建统治秩序，才使得他们不能够向更高的革命阶段迈进，取得更为辉煌的革命成果。