他重视祖国医学遗产，但不拘泥守旧，而注重于具体分析病情，灵活运用古方。他写的诊断书，言简意明，
所开药方，药少而疗效好，创造了不少起死回生的奇迹，因而被当时人们称为“神医”。
万密斋用了几十年的时间，总结和整理了祖辈和自己的临床实践经验，写出了数十卷很有价值的医书。每写一卷，他的弟子就辗转传达室抄，流行全国各地。其著作已印行的有《万氏家传育婴秘诀》、《万氏家传广嗣纪要》、《万氏家传妇女科》、《万氏家传痘疹必法》、《万氏家传伤寒摘锦》、《万氏家传保命歌括》、《万氏家传幼科发挥》、《万氏家传玉痘疹》等十部。这些书均收入《四库全书》，颁行天下。据《万氏家谱》记载，还有三十七种著作未付印，现除《万氏秘传外科》和《万氏家传点点经》两部外，余均已失传。
万氏著作的鲜明特色是：说理深入浅出，明白易懂，有很大一部分是用诗、词的形式写的，便于学习和记忆。同时，在继承传统的基础上，还有许多精辟独到的见解，为后世所推重。象清代医学家沈金螯、武之望;日本医学家丹波元坚、汤本求真;朝鲜医学家许浚等，都在自己的著作中授引了万氏学说，并给予很高评价。
历代名人养生诀
一德：明代养生家吕坤说：“仁可长寿，德可延年，养德尤养生之第一要也。”
二“字”：宋代苏东坡认为，养生在于“安”“和”二字。安即静心，和即顺心，“安则物之感我者轻，和则我之应物者顺。”
三“戒”：孔子曰：君子有三戒。“少之时，血气未定，戒之在色;及其壮也，血气方刚，戒之在斗;及其老也，血气既衰，戒之在得。“
四“法”：明代医学家万密斋指出：养生之法有四：一曰寡欲，二曰慎动，三曰守时，四曰却疾。
五“知”：宋代周守忠说：“知喜怒之损性，故豁情以宽心;知思虑之销神，故损情而内守;知语烦之侵气，故闭口而忘言;知哀乐之损寿，故抑之而不有;知情欲之窃命，故忍之而不为。”
六“节”：明代医学家江绮石说：“节嗜欲以养精，节烦恼以养神，节愤怒以养肝，节幸勤以养力，节思虑以养心，节悲哀以养肺。
七“食“：清代养生家石成金指出：“食宜早些，不可迟晚;食宜缓些，不可粗速;食宜八分，不可过饱;食宜淡些，不可厚味;食宜温热，不可寒凉;食宜软烂，不可坚硬;食毕再饮茶两三口，涑口齿，令洁净。”
八“乐”：石成金的八乐是：静坐之乐，读书之乐，赏花之乐，玩月之乐，观画之乐，听乐之乐，狂歌之乐，高卧之乐。
九“思”：孔子曰：“君子有九思：视思明，听寺聪，色思温，貌思恭，言思忠，事思敬，疑思问，愤思难，见得思义。