江西是明朝的(两京)一十三省之一，最高长官是巡抚江西都御史，也就是江西巡抚。但从明孝宗开始，江西南部又多出一个南赣巡抚，存在时间长达一百七十多年。
这个南赣巡抚是干什么的，和江西巡抚又是什么关系?
明孝宗弘治八年(1495年)，朝廷设南赣巡抚，全称是“巡抚南赣汀韶等处地方、提督军务”。这个“巡抚”，是作动词讲的。朝廷设这个职务的目的，是因为南赣(江西南部)实在是太乱了。
南赣北接江西北部，东接福建，南接广东，西接湖南，处四省要冲之地。很多年以来，南赣地区就是“盗贼”出没的天堂，各种“盗贼”在以赣州为中心的南赣发财，严重影响了该地区的稳定。
首任南赣巡抚是金泽，奉命南下“讨贼”。南赣巡抚还没有驻地，驻在南昌肯定不合适，金泽上疏奏请朝廷，允许把赣州当成南赣巡抚衙门驻地。理由有两条：一是就近便于“讨贼”，二是赣州城没有什么衙门。
因为“讨贼”顺利，到了弘治十八年(1505年)，朝廷撤销南赣巡抚。这本就是临时性的派驻机构，大家都觉得撤掉很正常。可是明孝宗驾崩后，明武宗正德帝即位，成天和那帮狐朋狗友胡闹，朝廷渐乱，南赣的“盗贼”又多了起来。没办法，正德六年(1511年)正德帝又重新设立南赣巡抚。
谁是巡抚呢?号称立德、立功、立言三不朽的圣人阳明先生王守仁。
从金泽或是王守仁的职责看，南赣巡抚偏重于军事，正德帝还特意给王守仁的南赣巡抚，加了“提督军务”四字，就是让王守仁“剿贼”，不要耽误自己的玩乐。
需要说明的是，南赣巡抚的管辖范围非常大，并不只是江西省内的赣州府、南安府、建昌府。弘治时设南赣巡抚，就管着江西的赣州府、南安府，广东的惠州府、潮州府、南雄府、韶州府，湖广的郴州府、福建的汀州府。正德帝复立南赣巡抚时，建昌府被划掉，增加了福建的漳州府。
南赣巡抚，相当于赣、湘、粤、闽四省“剿贼”总指挥，权力非常大。不过，朝廷也防着南赣巡抚势力坐大，尾大不掉。南赣巡抚可以统管以上各府的军事权，但对于各府的民政，朝廷规定南赣巡抚无权干涉。即使是南赣巡抚所驻的赣州知府，他都有权对南赣巡抚干涉本府民政的行为说不。以上各府的民政，还是要听各自巡抚的。
南赣巡抚的主要任务是“剿贼”，可活跃于这片区域的都不是“大毛贼”，最多也就万余人，呼啸山野，掠劫郡县。这些人虽也把朝廷折腾得够呛，但依然达不到李自成那样的大气候。
所以，南赣巡抚在很多时候都是没事干的，想管民政吧，又没这个权限。有的南赣巡抚就对自己的职务很不满意，说：当这个官，名声上好听，可什么都管不了。言下之意很清楚：无权管民政，就没了捞钱的机会。
之后的南赣巡抚，不说名存实亡，但实际意义不大了。南赣巡抚的管辖区域越来越小，嘉靖十年(1531年)，漳州归还福建，隆庆元年(1567年)，潮州、惠州划归新成立的广东巡抚管辖。
到了万历年间，南赣巡抚也开始涉及管辖区域内的民政事务。比如在各县修建学校，教化百姓。但由于地域上的限制，南赣巡抚的民政权限，主要集中在赣州。
明亡清兴。由于南方局势的动荡，清廷并没有裁撤南赣巡抚。赣州府和南安府，依然有江西巡抚和南赣巡抚两个顶头上司。当然，民政上还是以江西巡抚的意见为主，有什么事，江西巡抚拿主意，只不过事先和南赣巡抚通通气。南赣巡抚主管军事，和明朝没什么差异。
顺治后期，南赣巡抚又成了无事可做的闲差。辖内各府的钱粮、盐课、刑名都归原属各省巡抚管辖，南赣巡抚存在的意义已不大。康熙三年(1664年)，清廷裁撤了南赣巡抚，所属各府各归原属各省。