传统上人们一般认为唯物主义和无神论是一致的，唯心主义和有神论是一致的，但这种观点如今已经受到挑战，最新观点认为唯物主义和无神论并没有必然的联系，唯物主义者也可以是有神论者，这种观点称为“唯物主义有神论”。
唯物主义有神论认为神、灵魂等是有物质和能量基础的一种客观存在，并非是超于物质世界的纯粹精神存在。广州市社会科学院研究员苗兴壮在他的《揭秘灵界生命：神秘现象探索》一书中最早对唯物主义有神论进行系统的论证。
唯物主义有神论不像传统宗教把神看作是超自然的精神存在，只把神看作是一种生命形态，自然的一部分，自然中人们尚未认识的那部分，有某种物质和能量基础的生命体，使唯物主义和有神论不再对立，科学与宗教能达成统一(这里所讲的统一，主要是指自然科学能对灵魂、神、神迹等宗教要素的存在作出合理的解释，而不涉及到具体宗教教义中主张的道德规范、行为准则、仪式设置等，因为这些是与科学并行的，不存在冲突或统一的问题)。
唯物主义有神论还处于假说阶段，人们还无法证实可以构成灵魂和神的物质和能量存在，但随着物理学界暗物质和暗能量的发现和对其认识的进一步加深，这种假说的合理性和现实性得到加强。这是因为，如果构成灵魂和神的物质存在，那么这种物质应该具有以下几个特点：一、它的密度应该是非常小的，因为人或动物的肉体死亡后并没有发现其重量有明显的减少，至今还没有见到这方面的可靠实验证据;二、它应当是透明的，没有任何颜色，所以肉眼无法观察到其存在;三、它是没有任何气味和味道的，不能引起人们的嗅觉和味觉的反应;四、它在结构上是非常细微的，因而可以穿越任何其它普通的物质，并且与实体物质很少发生相互作用，因而现有的仪器设备还无法探测到它的存在;五、它聚合在一起后仍然具有很高的弹性和柔韧性，形状容易改变，其形状可以是不固定的。可喜的是这些特性与暗物质(dark matter)和暗能量(dark energy)的特性高度吻合。 根据科学家的描述，暗物质可以穿透任何普通物质，也不与普通物质发生任何相互作用，这类物质本身不会发出可见光、红外线、紫外线等任何电磁辐射，也不吸收和反射任何光，而且是完全透明的，因而难以探测，所以被称为暗物质。暗物质的这些特性都与上述特性高度一致。
虽然唯物主义有神论还处于假说阶段，但从逻辑上讲具有合理性，只是最终能否得到证实还需要科学的进一步突破，需要更多的时间。