清朝顺治七年十二月，炙手可热的摄政王多尔衮不幸病逝于塞外喀喇城，随后，年仅14岁的顺治帝亲政了，同时就在顺治八年的正月，蒙古科尔沁部卓礼克图亲王吴克善将女儿博尔济吉特氏送到了京师，以准备接下来的皇帝大婚。
然而，或许是因为正忙于处理多尔衮一党，顺治帝将大婚不断地推迟，因此，这位大清准皇后只得暂时由孝庄太后照看，值得一提的是，博尔济吉特氏正是孝庄太后的娘家侄女，即顺治帝的嫡亲表妹。随后，博尔济吉特氏便生了一次大病，不过在太医们的悉心调理下逐渐康复起来，这段时间，博尔济吉特氏的父亲吴克善(顺治帝的亲舅舅)也不断地私下走动于各王公大员之间，已催促皇帝早日完婚。
清朝顺治八年八月十三日，紫禁城迎来了清朝立国以来第一次皇帝大婚，顺治帝迎娶了表妹博尔济吉特氏，博尔济吉特氏入主坤宁宫，成为大清国入关第一位皇后，这份荣耀，对于科尔沁部来说，意义非同一般。
对于这位皇后，起初顺治帝是比较满意的，称其“容止足称佳丽，亦极巧慧”，然而，在经过一段时间的接触之后，顺治帝竟然与皇后分居了，顺治十年八月，顺治帝下诏废后，将博尔济吉特氏降为静妃，改居侧室。
顺治帝为何要废后呢?他给出了三个理由。
第一，皇后无能。第二，皇后是早年多尔衮所定姻亲。第三，没有经过自己亲自选择。
这三条理由，明眼人一看就站不住脚，自古以来，女人无才便是德，身为皇后的博尔济吉特氏，不需要有多大的能力。皇后即是多尔衮所定姻亲，顺治帝完全可以在亲政后将其退掉，然后再自己亲自选择。
后来，顺治帝在写给孝献端敬皇后的行状中给出了答案，原来皇后博尔济吉特氏不但奢侈无度，而且还嫉妒成性，这对于皇权至上的顺治来说，绝对是不能容忍的，因此才最终将皇后废掉。
博尔济吉特氏被废之后，便消失在了史料之中，而且，孝陵、孝东陵中根本就没有她的踪迹，这位大清废后究竟去哪了呢?
据《朝鲜李氏王朝实录》记载，顺治废后博尔济吉特氏返回了科尔沁部，并生下一子，而且“所生子亦贤”。然而，该书却记载这个孩子康熙四年已经十四岁(虚岁)了，也就是说，这个孩子是生于顺治九年，当时博尔济吉特氏还未被废，而且并无生子的记载，因此有人传言皇后是怀着龙胎回到故乡的，经过推敲，这个可能性也是比较小的。唯一的可能便是博尔济吉特氏返回家乡后，再次嫁人，最终生下一子，当然至于这位大清废后的最终结局，只能成为一个疑团了。