如果仅从朱见深后半生来看，人们对于他的抨击确实没有冤枉他。明宪宗朱见深一生当中最被人诟病的有三件事：宠信万贵妃、重用奸佞、大搞特务行动。
宠信贵妃本身没有什么值得诟病的，但朱见深宠信的万贵妃，却着实不是一位善茬。万贵妃名万贞儿，比朱见深大十七岁。万贞儿四岁时就进入皇宫，朱见深两岁时，万贞儿奉命照顾他。万贞儿的照顾使得朱见深对她极为依赖，两人展开一场身份、年龄皆极为悬殊的姐弟恋。朱见深继位以后，想要立宫女出身的万贞儿为后，但由于不合礼制而被生母周太后驳斥。立后不成，朱见深就将万贞儿封为贵妃，专宠于她，甚至为她将吴皇后打入冷宫。就这样，万氏凭借朱见深的专宠，在宫中肆无忌惮，安插亲信，干涉朝政。
万氏性格狠辣，她把持后宫，排除异己，只要有其他妃子或宫女怀孕，她就要将其暗算。著名的明朝皇帝明孝宗朱佑樘的生母就是被万氏害死，他本人也被迫过着暗无天日的生活，直到六岁时，朱见深才知道他的存在。朱见深将朱佑樘立为太子以后，万氏将朱佑樘生母逼死，抚养朱佑樘的恩人也被迫吞金自杀，可是朱见深却没有责怪万氏，反而在万氏的说辞下想要废掉朱佑樘。这样的丈夫和父亲，可谓是性情凉薄。
除独宠万氏以外，朱见深还重用奸佞，汪直与梁芳等奸臣得到宪宗宠信，他们在朝中肆无忌惮，扰乱朝纲，在外则大肆敛财，搜刮民脂民膏，搞得天怒人怨。而且，朱见深还大搞特务行为，他设立西厂和传奉官，加强皇权。特务组织的存在，使得大臣们遭受凌辱，恐怖的气氛弥漫在整个大明王朝之下，使得明朝的政治环境愈发畸形，贻害无穷。《明史》痛斥道：“夫明断如帝而为所蔽惑，久而后觉，妇寺之祸固可畏哉。”
看到这里，有人可能会觉得，这还有什么好说的，这不就是一位彻头彻尾的昏君吗?可是，历史的吊诡之处就在于，许多人还有着截然不同的一面。
清朝修订的《明史》，对于明宪宗朱见深评价极高，文中赞曰：“宪宗早正储位，中更多故，而践阼之后，上景帝尊号，恤于谦之冤，抑黎淳而召商辂，恢恢有人君之度矣。时际休明，朝多耆彦，帝能笃于任人，谨于天戒，蠲赋省刑，闾里日益充足，仁、宣之治于斯复见。”
这段评价不可谓不高，那么，这位“不是一个励精图治、有所作为的皇帝”，为何能得到后世人的赞誉呢?《明史》修订时，明朝早已覆灭，明宪宗的时代已经是历史了，清朝人自然没必要去讨好一位在整个明朝历史中不甚起眼的皇帝，朱见深能得到肯定，原因是他在位期间，明朝没有许多人想象中的那样坏。
首先，朱见深本人就不是一位娇生惯养、行事跋扈的皇太子，他少年时期的艰苦，比之儿子朱佑樘有过之而无不及。朱见深原名朱见濬，本是英宗朱祁镇长子，正统的皇太子，大明王朝的储君。可是朱见濬的父亲朱祁镇却想不开要去御驾亲征，最终在土木堡被瓦刺大败，沦为俘虏。当瓦刺大军袭来时，于谦等人站出来，拥立朱祁镇的弟弟朱祁钰为帝，并力挽狂澜，在北京保卫战中重创瓦刺，取得了胜利。
大明王朝得以保全，可是朱见濬的处境却艰险起来。朱祁钰不愿放弃帝位，他先是将回来的朱祁镇软禁，然后废掉侄子朱见濬，立自己的儿子为皇太子。就这样，朱见濬沦为沂王，遭受打击，精神接近崩溃，还落下口吃的毛病。景泰八年，石亨等人拥立朱祁镇复辟，朱见濬这才恢复太子身份，还改名为朱见深。
可是复辟以后的朱祁镇愈发昏聩，他大赏石亨等人，并听信谗言，处死于谦，使得明朝宦官专权，朝纲混乱，政治腐败不堪。朱见深继位以后，斩杀了东宫内侍王纶、翰林侍读学士钱溥、都指挥使门达等一大批奸臣。同时，朱见深还平反了于谦冤狱，恢复了于谦儿子的官职。有人在朱见深面前提起朱祁钰废他太子的事情，朱见深说道：“景泰事已往，朕不介意，且非臣下所当言。”朱见深不计前嫌，以德报怨，恢复了代宗的帝号。
朱见深在政治上很有作为，他继位以后，任用李贤为少保、华盖殿大学士，还提拔了彭时、商辂等贤才进入内阁，一时间朝堂上人才济济，政治清明。
在军事上，朱见深也很有建树，他平定了荆襄百万流民大动乱，征讨建州女真，大破努尔哈赤六世祖，解放大量汉人奴隶。朱见深在位期间，明朝多次主动出击，打击蒙古，且连战连捷，一扫明英宗土木堡之祸的阴霾。
这样的文治武功，不说与中国历史上其他朝代的贤君相比，单论在明朝诸位皇帝当中，明宪宗是不差的。只是可惜，由于宠信万氏，宪宗愈发迷失，最终落得个昏庸无道的评价。