拥有雄才大略的康熙，之所以迟迟不敢拿吴三桂开刀，实际上说明了对方的实力，确实是让皇帝不敢掉以轻心。然而在康熙最终下达削藩令后的一段时间，吴三桂的大军打得清军甚至没有还手之力，一度占据了长江以南的半壁江山。然而看似实力占优的三藩之乱，最终还是败在了摇摇欲坠的大清手里，这究竟是怎么回事呢?
首先，吴三桂的野心暴露过早。一开始他打出"反清复明"的口号很有关系，当时可以说是一呼百应、应者云集，这也保证了他在战场上势如破竹、占据上风。然而过了好长时间，他却迟迟不肯立明朝宗室为皇帝，到后来竟然自己选择了称帝，原本很多支持他的人，这时就选择了倒戈相向，这时的他已经不得民心了。
其次，吴三桂的胸襟不够开阔。看到他把事情搞得这么大，就连朝鲜都在那里蠢蠢欲动。除此之外，他还可以有两大强援，分别就是蒙古贵族，还有盘踞在台湾的郑成功后裔。如果这些势力运用得当的话，几路夹攻、里应外合，康熙会很狼狈。然而他在这方面的统战工作，其实是很失败的。
第三，吴三桂也有很多的无奈。虽然他的三藩声势浩大，但事实上他能够掌控在手中的，也只有他自己那一支部队，其它的充其量只能算是各怀鬼胎的盟军，这在军事调度方面是相当不利的。当时康熙看到无法抵挡吴三桂的进攻，就对另两家藩王进行了及时的分化。
第四，吴三桂在军事上犯了大错。即使有上面这些不利因素，但在起事之初，他的大军还是迅速控制了长江以南的大片地盘。这时候他最应该做的，就是趁清兵惶恐惊惧还没有回过神的功夫，迅速地发动闪电战打到北京。虽然这里有很大的风险，但"兵行险着"，原本就是取胜的应有之义。
就连他的军师，也多次敦促他尽快挥师北上，然而这时的他却有点举棋不定。其实他不肯跨过长江，反而给清兵提供了喘息之机。那些在北方地区，原本想要起事的士大夫阶层，看到越来越多的清兵，自然不敢轻举妄动，吴三桂也失去了最大的助力。
事实上如果吴三桂不想北上的话，他完全可以一路向东进发，把江南富庶之地收归己有。然而在他鼎盛时期，甚至连武昌都没有夺取下来，仅仅靠着西南地区的人口和粮饷，是不足以支持他长时期作战的。在他离世之后，吴氏后人更是难堪大用，自然不是康熙的对手。