朱元璋建立明朝初，就命人在北京给元世祖忽必烈建庙祭祀，洪武六年，又在南京建了历代帝王庙，把历代开国君王都供奉在一起，同样也包括元世祖忽必烈，后来干脆连元朝开国功臣的牌位也摆在边上陪祀。他自己恭恭敬敬的前去行跪拜大礼，标志着朱元璋承认元朝在中国的统治地位，与汉、唐等大一统的朝代一样，是正统。
朱元璋也不是心血来潮才这么做的，早在北伐时，他就要求军队不要伤害元朝的皇亲贵族。对俘获的元朝贵族也都以礼待之，赐予优厚爵位和俸禄。对于汉人来说，推翻蒙元的统治，是一件欢欣雀跃的大喜事，蒙古人歧视汉人，奴役汉人，如今终于扬眉吐气了，对待这些蒙元的统治者，恨不得生啖其肉以解心头之恨，可是朱元璋竟然连贬低元朝君主的词语都听不得。他说，“元主中国百年，朕与卿等父母皆赖其生养，奈何为此浮薄之言?”
按说，朱元璋的一家也并没有得到元朝的任何恩惠，反而在元朝统治下流离失所，父母皆饥饿而死，朱元璋应该与元朝有着深仇大恨才对，怎么会对元朝统治者如此礼遇，此举实在令人费解?
朱元璋的考虑颇为深远，尊元朝为正统其实就是建立一种“天命论”的表现。
在推翻元朝统治之前，他可以恨元入骨，他可以打出“驱除鞑虏，恢复中华”的口号，建立明朝新政权之后，他想的就是如何让自家的江山千秋万代。自己一介农民出身，还当过乞丐，当过和尚，没身份没背景，天下全靠一刀一枪打出来的。如果人人都效仿，有了“你一个乞丐都能当皇帝，那我也能行”的想法，都来起义争天下那还了得!
但是元朝，区区蛮夷之族，几十万人口，毫无礼仪教化，野蛮落后，比他这个农民乞丐的身份还要差一截，竟也能统治中国百余年，不是正能说明这就是天意么!既然是天意，那么现在元朝统治暴虐，上天重新选择了新的天子——就是他朱元璋。既然是上天的旨意，那么四海之内理应臣服。
所以朱元璋还是很功利主义的，这个时候就应该把个人情感和恩怨放下，为了彰显自己这个皇帝的正统性，他必须要不遗余力的坚持蒙古人的统治是“正统”。这样他给元朝皇帝磕头，经常表达对元朝统治的感恩之情，也就不难理解了。