明朝可能会更早灭亡。
张居正是一个政治家，主要能力是综合协调帝国的各个机构，他最大的本事是能帮助中央政府搞到钱，有了钱，中央政府才能够运转下去。而且张居正一直在中枢机构任职，这种全局观让他对整个明帝国有更加宏观的把控，知道该往哪里使劲。
一条鞭法虽然在张死后并没有延续下去，但是这种法令对后世影响深刻，甚至现代很多税法都是承袭自一条鞭法。张居正执政的十年时间，帮助明帝国增加了两倍的纳税土地，还有800万两国库收入，这些都支撑了万历后来的各种军事行动。
明末的时候，朝廷无法收到足够的税，导致了农民起义不断。再加上后金的不断侵扰，造成了腹背受敌的局面，最后彻底崩溃。可以说是张居正帮助明朝续命了几十年，否则明末财政崩溃，无法支撑的局面要提前几十年出现了。
海瑞则是一尊门神，他的主要作用是震慑那些犯事的小鬼们。如果把门神放到了首辅的位置，他不一定能协调好各方势力。而且太过刚直的性格让他难以跟同僚们相处，毕竟首辅也得让人帮忙干活，否者政令不出内阁，是无法推行好法令的。
海瑞在政治上是有洁癖的，如果让他去圆滑市侩的办事，他是做不到的。比如说戚继光当初为了得到朝廷的支持，都曾经有意结交攀附张居正，戚继光得到了力挺，明朝的边界也难得安宁了一段时间。如果是海瑞在位，恐怕戚大将军就提前退休了。
所以综上可以看出，在明朝后期，一个能搞到钱的政治家在首辅的位置上，会比一个门神上位更加适合。水至清则无鱼，海瑞很适合作为一把利剑，去祛除大明身上的手足之疾，而给朝廷续命的重任，还是需要张居正这样的政治家来承担。