《申报》原名《申江新报》，1872年由英国人美查于上海创刊，乃近代中国第一份最有影响力的报纸，在启迪民智与传播要事上居功厥伟，但在1907年被华商收购前，其立场不免替欧美回护，并时时引用英媒《泰晤士报》与《字林西报》报道评点中国，故时而出现双重标准的尴尬。尤其在左宗棠率领湘军于1876年预备西征收复新疆之时，《申报》更是杜撰许多子虚乌有的“假消息”误导视听想阻止清军步伐。总的来说，可分为财政、军事与善后等三方面。
在沙俄以及大英帝国的幕后支持下，阿古柏于1865年至1877年率军入侵中国新疆，史称"阿古柏之乱"。阿古柏于据地称王后，曾相继向英国、俄罗斯与奥斯曼土耳其等国求援或缔约。因此为了分裂中国与扩大在华利益，英国既透过官方表露不希望清朝收复新疆的心思，又通过报刊鼓吹“复疆必败”的论点，希冀影响清廷决策，在很大程度上也让力主“海防”派的官员有了口实去反驳“塞防”派。
财政上，《申报》屡次刊载“新疆劳师糜饷不胜计数， 实为中国之累。以有用之财取其不毛之地，已属失算”、“中国收回新疆后非竭关内各省之财力不足以守，其耗费定非前代所能及”之类的意见，甚至胡乱编派左宗棠“自前岁用兵关外，至今所用兵饷将及千万两，兹再借一千万两”、“左帅于去年借用西国之债一千万两之后，复欲借贷西国之债二千万两”的新闻。
然而，左宗棠在1875至1878年之间的戡乱军费年均不过881.7万两，借款虽达2千多万两，但实际上是向华商与洋商借款的合计，根本没有《申报》所报道的那样夸大，且在光绪年间很快就还清，也因此更没出现《申报》所举的奥斯曼土耳其“仅恃每年告货积债，临近亡国”的败象。
军事上，《申报》杜撰的报道可谓汗牛充栋，这篇不是说左宗棠部下缺饷哗变、那篇就是说清军避战毁城，或是干脆宣称阿古柏大军已占领嘉峪关、甘肃全省“沦陷”的警讯。1876年6月1日《申报》还刊登《陕甘传闻》，称左宗棠大军已遭阿古柏截断同内地的联系，川、陕、晋、鄂等省正派兵火速出关救援。但彼时左宗棠部正顺利向哈密与吉木萨尔进军，军粮辎重也正川流不息地自甘肃向新疆转输，根本没被隔断。最让读者哑然失笑的是，6月5日《申报》竟发布了《西陲恶耗》这么一则爆炸性“独家”，称“传左爵相统领大兵西征回部，近已败退，爵相亦阵亡”，将活生生一个左宗棠给写死了。
善后上，《申报》既在预算与军事上替大清“操心”，又“善意”地提供诸多善后之策，比如主张让阿古柏成为像朝鲜、安南那样的藩属国，中国还可与之签约通商牟利。还有于社论《再论借贷征回事》宣称：“新疆之地如此难于处理，不如与欧洲各国商议，中国与欧洲各国均不必据有其地，于各回部中择定最为驯良为回人所共服者，立之为君，以为亚、欧两洲枢纽之国，使为两洲不侵不叛之臣，如春秋时间于晋楚之郑，庶几可为中国之藩篱，不费中国之财力，又不至为欧洲各国所夺取，否则中国自行守边于数万里沙漠之外，直欲驾秦皇而上之，岂长久之计乎?”说白了，就是遵循英、俄的方针，令阿古柏政权摇身一变为“正常国家”，不让清朝收复西陲失土。
面对这些奇言怪谈，左宗棠很是痛恨，痛骂过“《申报》本江浙无赖士人所编，岛人(指英国人)资之以绐中国”，但他更厌恶部分士人动辄拿西洋报刊言论替自己观点撑腰。比方李鸿章上奏节省西征军费以备海防的奏折，就提过“外国新闻纸及西路探报”是他搜集新疆情报的来源之一，而他“一面招抚伊犁、鸟鲁木齐、喀什噶尔等回酋，准其自为部落，如云、贵、粤、蜀之苗、瑶土司，越南、朝鲜之略奉正可矣”的弃疆主张，也被学者发现同《申报》社论脉络相仿。
左宗棠因此很不满地向友人抱怨道：“《申报》乃称回部归土耳其，土耳其已与俄、英通款贸易，中国不宜复问。合肥(指李鸿章)据以入告，并谓得之亦不能守。此何说也?”，还意有所指地批评“洋事坏于主持大计者， 自诩洞悉夷情，揣其由来，或误于新闻纸耳”，对李鸿章等人偏信西洋报刊贻误国政的行径颇不以为然。虽然这其中掺杂湘淮政争的私怨，且对于信息不够流通、交通尚未现代化的彼时中国来说，利用报刊洞悉西洋动态也无可厚非，连左宗棠本人也读《申报》。但若毫不考究便随手引之为决策的参考，委实过于轻率，更容易落入欧美列强设好的语境与政治陷阱里，李鸿章在这点上不能不受检讨。