在当代生物学界，主流观念认为，现代人类的祖先，来自非洲。并且，东亚起初的人种并非现代的黄种人，而是矮黑人种和棕色人种。黄种人将东亚的原住民驱逐以后，经过千万年的繁衍，形成了当代东亚人种的格局。
只是，很多人不理解这一点：中日韩三国的人都是东亚人种，但是在语言方面，居然不属于同一个语系，这其中原因何在?
族源与语言
虽然按照“非洲起源论”角度，全世界的人类祖先都来自非洲，但是，在直系祖先方面，中国先民的祖先和日韩先民的祖先，却并非一路人。
在西周时代，东北亚地区存在一个秽貊部族，秽貊部族在西周时代曾臣服于大周天子。到了东周，秽貊部族曾遭到齐桓公的讨伐。中原列国争雄期间，秽貊部族逐步迁入到了韩半岛，形成了三韩部族。之后经过漫长的发展，三韩部族成为了今天韩国人的祖先。
而韩半岛南部，存在着一些原住民部落。这些原住民中，一部分则迁移到了日本列岛，征服了日本的原住民，成为当代日本人的祖先。
韩语属于阿尔泰语系的语言，和蒙古语、突厥语属于同一种语系。因此一般认为，韩国人的祖先，同蒙古、突厥有着颇深的渊源。而汉语属于汉藏语系，一般认为，汉人和藏民在亲缘上近很多。日本语的语系，一般认为贴近阿尔泰语系。
因此，对于语系不同，可以理解为：直系祖先有着不同，从而导致语系不同。
人种问题
中国的武王伐纣以后，殷商宗室箕子带领殷商族裔来到韩半岛，建立箕子朝鲜，并驱逐了当地的原住民，在这期间，来自中原的人种，少不得和韩半岛的本土居民进行互动。
之后历朝历代，都有来自中原的势力渗透韩半岛——比如汉朝初年，卫满朝鲜就是汉朝叛将所建立的，后来这个政权被汉武帝所覆灭。而这期间，日本处于石器社会状态。
日本在经过石器社会以后，一夜之间进入了铁器时代，而日本的这次文明飞跃，公认是受东亚大陆文明输入影响——这也说明，在史前时代，日本并没有独立于东亚的发展体系之外。
而中原的力量不断进入韩半岛，导致很多韩国人有来自中原的祖先——比如有媒体认为，韩国前总统卢武铉是东汉名臣卢植的后代。而这种“输血”，导致日韩的基因发生变化，因此，东亚的人种，有了强大的趋同性。