作为历史上最著名的政变之一，靖难之役充满了传奇，是历史上唯一以一隅击败全国的战例，但也留下了无数疑问，其中一个是：朱棣攻克南京之后，假如朱允文不跑(朱允炆应该没有自杀，而是逃出去了)，坐等朱棣上门，朱棣会杀他吗?
在很多人眼里，斩草除根才是常态，才能体现皇帝的狠辣和霸气，但其实不然，纵观华夏历史，篡位时直接杀掉前任帝王的行为只占少数，多数还是礼待之，至少表面上礼待，最典型的是汉献帝刘协，退位禅让曹丕，降为山阳郡公，但保留天子礼仪，最后还比曹丕多活了8年，而山阳公国持续了89年，寿命比魏国还要长。
可见，政变未必要斩草除根，如果朱棣俘虏朱允炆，那么会是“优待”他，还是会直接斩草除根?
朱棣靖难旗号是“清君侧”
1398年，朱允炆继位之后，立即就与亲信大臣齐泰、黄子澄等采取一系列削藩措施，并在北平周围及城内部署兵力，又以防边为名，把燕王朱棣的护卫精兵调出塞外戍守，目标直指燕王。
朱棣不反，最好结局是被剥夺军权，然后做一个安乐王爷。前途过于险恶，朱棣没得选择，只能起兵自救，但起兵也要讲策略，最适合的一种莫过于“清君侧”，名义上不是造皇帝反，而是说奸臣在侧。更为关键的是，按照当时律法，朱棣靖难完全合理合法。
朱元璋在位时，担忧权臣篡权，规定藩王有移文中央索取奸臣和举兵清君侧的权利，他在《皇明祖训》中说：“朝无正臣，内有奸逆，必举兵诛讨，以清君侧。”朱棣以此为理由，指责齐泰、黄子澄为奸臣，须加诛讨，最终口号是“清君侧，靖国难”，名义上不是反皇帝，而是除奸臣，合理合法，所以靖难之役中很多藩王保持中立，原因就在于此。
既如此，朱棣有何理由杀朱允炆?
弑君罪大且容易引起众怒
古往今来，弑君罪大恶极，所以弑君者几乎都没有好下场，唯一美名远播的是周武王。武王伐纣时，也搞不清到底是谁杀了纣王，但周武王对纣王补了三箭，这是有史书记载的。其他的弑君者，要么声名狼藉，要么死于非命，鲜有功成身退者，离我们最近的是吴三桂杀永历皇帝，后果很严重呀。
朱棣遇到的情况还非常特殊，与朱允炆是叔侄关系，同时当时还有很多手握兵权的藩王，与朱棣是兄弟关系，与朱允炆是叔侄关系。朱元璋一共有有26个儿子，除了太子朱标和另外2个儿子没有就封之外，有23个就封包括朱棣，手上掌握兵权，经过朱允炆削藩，还是有不少藩王掌握兵权。
因此，朱棣于情于势，都不可能做出弑君行为，就是“前任皇帝最好死去，但不能死在我手里”。一旦做了，名声肯定臭不可闻，且给予其他藩王借口反他。
二王三恪的政治礼制
中国还有一个政治礼制，即“二王三恪”，历代王朝皆封前代王室后裔爵位，称为二王后、三恪，给予王侯名号，赠予封邑，祭祀宗庙，以示尊敬，显示本朝所承继统绪，标明正统地位。所谓“恪”，即表尊敬之意。杜佑《通典》考证“三恪二王后”，以为封前二代后裔为二王后，封前三代后裔则称为三恪。
上文讲的汉献帝就得到这一礼遇，还有隋朝时期，李渊先立杨广之孙杨侑(隋恭帝)为帝，后来又将他废掉，降为酅国公，软禁在长安，但酅国公却一直传承到五代十国，比唐朝国祚还要长。
因此，又有叔侄关系，朱棣很难直接杀了朱允炆。
当然，朱棣不会直接杀死朱允炆，不代表他不想朱允炆死，因此战败之后的朱允炆命运又已注定。
笔者猜测，如果朱棣攻入南京之后，朱允炆不跑，朱棣暂时只会继续奉他为帝，但会掌握实际掌握摄政大权，等到一定时候会搞“禅让”把戏。禅让之后，朱允炆的命运无非是莫名其妙死去，或被一生软禁等死。