在频频的接触中，福临深为汤若望渊博的学识与高尚的品德所折服。对各种知识都感兴趣而又好学的福临，向汤若望请教有关天文历算、社会人生等各种问题，他总是以获得新鲜的知识而感到惬意，并愈加尊敬汤若望。
汤若望在福临的心目中威信最高，福临对他几乎达到了言听计从的地步。而福临在逝世前立三子玄烨为皇太子为帝位的继承人，也是采纳汤若望建议的结果。后来福临由于完全被和尚所包围，才与汤若望有所疏远，但对其始终怀尊敬信任之情。
顺治帝亲政前，汤若望已深得摄政王多尔衮的信任，多尔衮对他能预知天象，通晓物理的本领相当敬佩，允许他在天文呈报中可以加上自己的见解。
因此汤若望不但能通过钦天监监正这个特殊的官职，广泛结交宫内外宗室权贵，而且可以利用中国封建统治者对大自然规律的敬畏心理，把自然界的变异与统治吉凶联系在一起，用“上天示警”的预兆，进劝统治者不要采取激化矛盾的措施。汤若望受到满族官员的尊敬，在朝中颇有威望。
他曾以多尔衮擅权专政提醒过幼小的皇帝。并根据自己的医学常识以及他所了解的多尔衮的健康状况，作出多尔衮将不久于人世的判断。汤若望这样做在当时无疑具有很大的风险。1651年1月，多尔衮病逝。
汤若望不失时机地为顺治帝选择了亲政日期，在多尔衮丧期刚满的2月1日，顺治帝宣布亲政，御太和殿，巩固了清初的政权，因此他得到了顺治帝和皇太后的好感和信任。
顺治帝非常钦佩汤若望的道德与学问，与之保持很好的关系。汤若望曾以他的医学知识治好了孝庄太后的侄女、顺冶帝未婚皇后的病，为此皇太后对汤若望很感激，认他为“义父”，随后顺治帝也尊他为“玛法”(满语，尊敬的老爷爷)。
为了表示对汤若望的好感，1651年9月，一天之内加封汤若望通议大夫、太仆寺卿、太常寺卿三个头衔。使他从原来的正四品晋升为三品。同时又加封他的父亲、祖父为通奉大夫、母亲、祖母为二品夫人。还将诰命封书，邮寄到汤若望的家乡。
其后又多次加封。1654年，加封为“通玄教师”。1657年，赐“通政使司通政使”。1658年2月2日，赐“光禄大夫”，为正一品。1661年按清廷惯例加封其祖三代为正一品。