燕子矶自古是金陵名胜，就在乾隆“御碑亭”东侧不远的半山腰处，也有一座静静伫立的碑亭——燕子矶江滩遇难同胞纪念碑。1937年12月，5万多解除武装、在燕子矶江滩等待渡江的中国军民，被日军包围封锁，逐一射杀。屠杀结束后，附近四座寺庙的几百名僧侣，面向尸山血水，为亡魂诵经超度。
“日夜机枪哒哒声不绝，俱击毙我同胞也”
1937年12月，南京城破在即，原本宁静的燕子矶乡间，挤满了从城里逃出的军民。8年后，一名叫刘守春的警察，向还都南京的国民政府，讲述了当时他在燕子矶的见闻。根据《原罪——侵华日军在南京栖霞暴行录》一书，刘守春看到，日军士兵“每见中国青壮年者，掳掠至江边……用机枪击毙之，日夜机枪哒哒声不绝，俱击毙我同胞也。”他所属的首都警察，一部退到燕子矶，被“枪杀约有二千余”。血战南京的国军第88师，在沦陷后被打散。年仅19岁的士兵郭国强躲进今天幕燕风光带景点之一的“三台洞”，一天一夜的枪声后，郭国强看到，在江滩上已经堆积了两万多“中央军”士兵的尸体。在躲过日军的盘问后，郭国强逃至八卦洲的下坝村定居下来，直至抗战胜利。
江滩成为刑场。战后国防部审判战犯军事法庭判定，死难同胞“在五万人”以上。日军离开后，燕子矶一带四座古庙的几百名僧人，发现江滩的尸山血海。所有人一起跪拜，口念《弥陀经》《往生咒》。
碑亭“缺一角”警示今人毋忘山河破碎之耻
虽然在战后的远东国际军事法庭审判时，中方未提出燕子矶的集体屠杀，但多方证据下，日军犯下的罪行无可辩驳。1985年8月，南京市人民政府设立了燕子矶江滩遇难同胞纪念碑。
这是一处设计为碑亭形式的纪念碑。值得注意的是，这座亭子只有三个角，平面看，是一个等边三角形。而中国园林中，传统的亭子要么是四个角，要么是五角或六角。“这不是设计者的疏忽，也不是建成后的自然损害；而是在建亭子时有意缺一个角的。”三角亭，象征着中国版图少了一角，目的是要人们记住这一丧权辱国的奇耻大辱。保留的三个角，呈握拳状，象征着中国人民的意志和力量：中国人民一定会赶走侵略者，在世界上站立起来的！