1787年，土耳其要求俄国归还克里米亚，承认格鲁吉亚为土耳其的属地，并对出入海峡的俄商船进行检查。俄国拒绝土耳其的要求，土耳其遂出动军队对俄开战。土耳其出动了20万军队和一支强大的舰队(战列舰19艘、巡航舰16艘、轻巡航炮舰5艘)对俄开战。俄军统帅部展开了两个集团军：叶卡捷琳娜集团军(8.2万人，由波将金元帅指挥)和乌克兰集团军(3.7万人，由鲁缅采夫元帅指挥)，以及克里木军和库班军，此外，还有黑海舰队(军舰24艘，由海军少将沃伊诺维奇指挥)。1787年8月21日，土耳其舰队的大部兵力向停泊在金布恩附近的俄国护卫舰发起攻击。9月13日夜，土军700人在金布恩沙咀登陆，但被俄军击溃。第二次俄土战争的爆发，让瑞典国王古斯塔夫三世觉得这是一个千载难逢的机遇。
1788年，也就是俄土战争的次年。古斯塔夫三世对叶卡特琳娜二世宣战，俄瑞战争再次爆发。 俄国遭土耳其和瑞典南北夹击。俄力图避免两线作战，但无济于事。在腹背受敌的情况下，俄以次要兵力在北线实施防御，把主力放在南线，以对付土耳其。俄军波罗的海舰队一部，7月上旬，奉令出海寻歼瑞典舰队。古斯塔夫三世和瑞典统帅部的战略目标是掌握波罗的海制海权和夺取圣彼得堡，为此拟订了详细的作战计划——由卡尔·南曼兰海军元帅指挥的瑞典舰队摧毁俄国舰队，并将其残部围困在喀琅施塔得，然后运送2万名海军陆站队员在奥拉宁包姆地区或红山炮台附近上陆，以夺取圣彼得堡。根据这项计划，战争的决定权在海上。
俄罗斯在1703年5月建立了圣彼得堡，同年秋季修筑喀琅施洛特炮台，为建立喀琅施塔得海军要塞(1724年后为波罗的海舰队的主要基地)奠定了基础。1704年在彼得堡创建兵船修造厂，该厂后来成为俄国的造船中心。北方战争期间，在波罗的海舰队协助下，俄军攻克维堡要塞、雷瓦尔、佩尔诺夫、里加、赫尔辛福斯和奥布等港口以及蒙海峡群岛。在汉科角海战、厄塞尔海战和格伦加姆附近作战中，波罗的海舰队均获胜利，使俄国在波罗的海站稳了脚跟，并成为海军大国。到1722年，波罗的海舰队已拥有帆船130艘(含战列舰32艘)，桨船近400艘。舰队当时采用终身服役的募兵制补充兵员。
彼得一世在位时，在海战中功绩卓著的海军将领有：阿普拉克辛、谢尼亚文、戈利岑和戈洛温。七年战争(1756—1783)期间，波罗的海舰队封锁了松德海峡以阻止英国舰队进入波罗的海，进行了战役运输，参加了攻占梅梅尔和科尔贝格的作战。俄土战争期间，波罗的海舰队组建了几个分舰队，前往地中海同土耳其舰队作战。派到地中海战区作战的波罗的海舰队的舰艇在切什梅海战、阿索斯海战和纳瓦里诺海战中打败了土耳其舰队，取得了巨大胜利。这些胜利的取得是与斯皮里多夫、谢尼亚文、格雷格等俄国海军将领的指挥分不开的。舰队采用终身服役的募兵制补充兵员。舰队军政由海军院负责，只在战争期间才临时委派舰队司令指挥。