在1941年5月克里特岛陷落后，所有希腊领土已完全由轴心国控制，在未来3年将受到德国、意大利及保加利亚残酷的共同占领，在被占领的国家内，一个有效的抵抗网络被建立起来及在1944年已解放了大部份山区，同时，希腊的军队及舰只仍然在北非及最终在意大利与英国海军共同作战，当德军在1944年10至11月间从巴尔干半岛撤退后，希腊除一些个别岛屿仍有德国守军驻扎外已全部被解放，但是，国家随即陷入新的冲突中，即希腊内战。
虽然轴心国在希腊之行动取得全面胜利，希腊对意大利入侵的抵抗对第二次世界大战之进程有重大影响，一些历史学家认为，德国在巴尔干的干预推迟了巴巴罗萨行动及造成伤亡，特别是在克里特岛的空降作战对飞机及伞兵付出代价及影响战果，在与莱尼·里芬斯塔尔的谈话中，希特勒痛苦地说：“如果意大利没有进攻希腊及需要我们帮助，战争的进程将会大为不同，我们可以在俄罗斯严寒来临前攻占列宁格勒和莫斯科，更不会有之后的斯大林格勒战役。”，加上占领希腊需要镇压游击队及防守该地以防盟军进攻，在战争中牵制了一些德国及意大利师团(不过多数是战力较差的次级师与外籍武装亲卫队)，但是其他历史学家如安东尼·贝福却指出不是希腊的抵抗，而是在欧洲东部机场的缓慢建设令轴心国推迟入侵苏联。
同时，但是希腊的抵抗最终需要盟国的干预，最终派遣英军到希腊是基于政治上的考虑，在事后艾伦·布鲁克将军的说话承认这是一个明确的战略失误，在当时的非常时期将兵力从中东分散到希腊，这支兵力不足以对抗德国对希腊之入侵，但如果用在北非战场将发挥决定性的作用，将令胜利提早来临。