孔四贞幼时，曾为吴三桂养女。顺治九年(1652年)，李定国奇袭广西，攻破桂林，孔有德自尽，其家一百二十余口悉数被杀，仅余一女，即孔四贞。清人杨陆荣《三藩纪事本末》记载：“惟一女年十七，逸出城，单骑走京师，哭于朝。世祖(指顺治)怜而养之宫中。”清人叶梦珠在《续编绥寇纪略》言及：“世祖怜之，将册立为妃，知先许孙延龄(其父部将孙龙之子)，乃止。”封孔四贞为“和硕格格”，即郡主。《清史稿 列传二百六十一》则说“孝庄皇后育之宫中，赐白金万，岁俸视郡主。”
四贞出身将门，随父军中，性情刚烈。嫁给孙延龄后，在丈夫面前趾高气扬，孙延龄心机颇深，最初对孔四贞百般恭敬，孔四贞遂为他在宫廷游说，使延龄得宠朝中。康熙四年(1665年)，延龄怂恿四贞请求朝廷准许他们“就食广西”，皇帝批准。后来延龄夫妇举家南下，孙延龄便渐次排挤了孔四贞，夫妻感情恶化。
康熙十二年(1673年)，发生三藩之乱，吴三桂起兵反清，并引诱孙延龄起兵响应。此时孔四贞懊悔异常，“日夜感上恩，劝延龄归顺”，延龄首鼠两端，犹豫不决，后吴三桂派吴世琮袭杀孙延龄。孔四贞曾有一子，也被吴世琮所杀。后来吴三桂把四贞接到云南，以为笼络原定南王部属，事实形同软禁。孔四贞待在昆明八年，直到“三藩之乱”被平定后，才辗转返回京师，晚景凄凉。孟森说她“从此为孤豚腐鼠，不过为孙氏一老寡妇，无争相取重者矣”。传说死后葬在今北京公主坟，该地乃因此得名。但已经考证此说不实。