曹化淳幼时家境寒微，受“近君养亲”风气的影响，于十二三岁左右入宫。因天资聪慧，勤奋好学，在宫中受到良好的教育，诗文书画，样样精通，深受司礼太监王安赏识，倚为亲信。后入信王陪伴侍奉五皇孙朱由检。天启初年，太监魏忠贤得宠弄权，害死王安，曹化淳受牵连被逐出北京，发配到留都南京待罪。1628年朱由检继皇帝位，改元崇祯，曹化淳随即被召还，委以重任，平反冤案。因办事得力，深得崇祯皇帝的信任和倚重。至崇祯四年，曹化淳在宫中的地位已相当显赫。该年夏，曹化淳主持在家乡王庆坨建造了玄帝殿和观音阁，并亲撰碑文。
崇祯十一年，任司礼秉笔太监、东厂提督，总提督京营戎政的曹化淳因病乞准告假，向崇祯帝连上三疏。
崇祯十二年二月，曹化淳蒙允告假还乡。
曹化淳同胞兄弟五人，三兄化富、四兄化勤早丧，曹化淳与同朝为官的次兄后军都督化雨关系最为密切。崇祯十六年六月六日，曹化雨病逝，因长兄化春年迈，殡葬及转年春立碑、建亭等事均由曹化淳亲临料理。