裴子野出生于世族家庭，曾祖裴松之，南朝宋太中大夫，曾为《三国志》作注;祖父裴骃，南齐中郎外兵参军，著有《史记集解》，都是著名史学家;父裴昭明，南齐通直散骑常侍。裴子野出生后母亲病逝，由祖母殷氏抚养。殷氏“柔明有文义，以章句授之”。不幸，在他九岁时，祖母也去逝了。裴子野悲痛万分，哀毁过人。
裴子野聪颖早慧，勤奋好学，少年时代就以善于著述文章闻名。年轻时即开始步入仕途，初任南齐武陵王国左常侍，后为江夏王参军。南齐中兴二年(502年)，父裴昭明去世，裴子野辞官回乡。正在这时，南齐王朝也被萧梁王朝替代了。
萧梁初始，梁尚书仆射范云很赞美裴子野的文才、品行，准备上表推荐他，可惜未奏就突然去世了。当时文学家任昉颇负盛名，很多文人投靠到他门下，请求推荐仕官，唯独裴子野不愿走这条捷径，为此任昉很恼火，不在朝廷为他说好话。过了很久，裴子野才任安成王参军，兼廷尉正。廷尉是掌刑狱的机构，一次廷尉上奏一件判狱，裴子野不在场，同僚们代他签了名。谁知，梁武帝对此案很不满意，把办案的人全撤了，裴子野也在其中。有人劝他把事情真相讲明，可官复原职。裴子野笑着说：“丢官固然可惜，我岂能靠诉讼辩解当官呢?’他在家呆了很久，终无悔意。著名无神论者范缜在朝中任国子博士，与裴子野素未相逢，却很敬佩他的学识和为人，上奏请朝廷将自己的官职让给裴子野。朝廷以裴子野资历太浅为由，未予采纳。过了很久他才任尚书比部郎，仁威记室参军，后又任诸暨(今浙江诸暨)令。任职期间，以理取信于民，“百姓称悦，合境无讼。”数年后，裴子野被吏部尚书徐勉推荐为著作郎，掌修国史及起居注。后又兼中书通事舍人，掌中书诏诰，不久又迁中书侍郎。梁大通元年(527年)转鸿胪卿、领步兵校尉。中大通二年(530年)，死于任上，终年六十二岁。
裴子野仕官期间，忠子职守，任劳任怨，且为政清廉，是—尘不染的清官。他把朝廷的俸禄分摊给生活困难的亲戚朋友，自己则与妻子恒苦饥寒，居住在数间茅草屋内，“唯以教海为本”。晚年信奉佛教，严守戒律，病重期间“遗命俭约，务在节制’。裴子野死后，梁武帝为之流涕，亲下诏书，称“文史足用，廉白自居。谥曰贞子”。据说过去，五品以上的官职才有谥号， 裴子野“以令望见嘉”破了先例。裴子野下葬，湘东王萧绎亲自写墓志铭，藏在墓葬中，邵陵王萧纶为他立墓志，立于墓道中，“羡道列志， 自此始焉”。子裴謇，官至通直郎。