舂陵起兵
李氏家族是南阳的豪强大姓，李轶的伯父李守是王莽的宗卿师，李轶的堂兄李通也担任过五威将军从事等官职。
公元22年(地皇三年)，绿林军大起义爆发，南阳为之骚动，李通因为当时流传的图谶上讲“刘氏复兴，李氏为辅”，便也有起兵的心思，因为李轶向来是个好事之徒，李通便把李轶找来共同商议此事。李轶就对李通说：“现四方扰乱，王莽政权眼看就要垮台，汉朝要重新复兴了。南阳的刘氏宗室之中，只有刘縯、刘秀兄弟能泛爱并容纳豪杰，李家可以与他们共谋灭王莽兴汉朝的大事。”李通笑着说：“我的意见也是这样。
不久，刘秀因为逃避官吏的追捕，来到宛城躲避，李轶就奉李通之命来找刘秀共商大事，双方一拍即合，决定同时起兵。随后，李轶就随刘秀回到舂陵，准备举兵。
李轶走后，因为起兵计划泄露，李氏在长安和宛城的族人被官兵捕杀，几乎灭门。公元22年(地皇三年)十月，逃过灭门之难的李轶，随刘氏兄弟城舂陵起兵，直到在参加攻打棘阳的战斗时李轶才与逃出宛城的李通重逢。
谋杀刘縯
刘縯、刘秀兄弟起兵之后，因为力量过小，就与绿林军联合，当时绿林军势力非常大，刘縯、刘秀兄弟的实力比较弱，李轶就抛弃了一同起兵的情谊，开始拼命讨好朱鲔等绿林军将领。
公元23年(新莽地皇四年，刘玄更始元年)二月，绿林军拥立刘玄为帝，建立了更始政权，李轶被任命为五威将军。五月，王邑、王寻统帅的新朝大军与包围了绿林军控制下的昆阳，昆阳之战爆发。面对强敌，刘秀、宗佻、李轶等十三骑突破重围，去搬救兵，最终内外夹击，大破敌军。
昆阳大战之后，由于刘縯、刘秀兄弟威名鹊起，越来越响亮，刘氏兄弟与绿林军将领的矛盾越来越大，在这种情况下，李轶彻底与刘氏兄弟分道扬镳，他和朱鲔等人一再进言，劝刘玄早点动手杀了刘縯，以免留下后患。对李轶的变化，刘秀敏锐觉察到了，刘秀对刘縯说：李轶这个人不能再信任他了。”但刘縯并不放在心上。不久之后，在李轶、朱鲔的一再建议之下，刘玄搜捕杀害了刘縯。
朝延新贵
公元24年(更始二年)二月，刘玄迁都长安之后，打破汉高祖刘邦的祖训，封了十三个异姓王，其中李通封为西平王;李轶封为舞阴王，他们的另一个堂兄弟李松则出任了丞相。一时之时李氏一门权高位重，成了炙手可热的朝廷新贵。
李轶，想见李轶一面，在等很长时间。济南太守耿艾的儿子耿纯也来拜访李轶，他见此情景，就规劝李轶，他说：“大王以龙虎之雄姿，逢风云之际会，迅速拔地而起，一月之间兄弟称王，但士民们并不知道你有什么德行，你也没有对百姓宣扬有什么功劳，恩宠与官位暴兴，这是聪明人所忌讳的。兢兢业业警惕自持，还恐怕没有好下场，何况是骤然暴发而自足，难道可以成功吗?”李轶听了耿纯的话，感到很耿纯说的有道理，也安排耿纯做了官，但他并没有听从耿纯的规劝。
暗通冯异
就在李轶志得意满之际，从河北传来一个消息：刘秀已经扫平河北，大有西进长安之势。为了防备刘秀的进攻，公元24年(更始二年)冬十二月，刘玄派朱鲔、李轶、田立、陈侨等人率领大军三十万，以洛阳为中心，构筑中原防御体系。刘秀方面则任命冯异为孟津将军，率领魏郡、河内两郡兵马镇守孟津渡，与朱鲔、李轶的洛阳大军隔河对峙。
一开始，李轶是铁了心防守洛阳，比如他发现冯异的副将竟然是更始政权叛逃到刘秀方面的刘隆，就将刘隆的妻子、儿女无论老小全部抓起来，杀了个干净。但是随着形势对更始政权越来越不利，李轶也开始寻找后路了。而就在此时，冯异给李轶写了一封信。
冯异在信上说：“我听说明镜是用来照形的，往事能用来说明今事的道理。以前微子离开殷商而入周，项伯叛楚而归汉，周勃迎代王而废黜少帝，霍光尊孝宣而废昌邑王刘贺。他们都是畏天知命，看到了存亡的征兆，见到了废兴的事实，所以能成功于一时，垂伟业于万世哩!假如长安还可以扶助，延期岁月，疏不间亲，远不逾近，你李轶怎么会独居一隅呢?现长安坏乱，赤眉已临近市郊，王侯们制造灾难，大臣们各怀去意，朝纲法纪已经绝灭，四方分崩离析，异姓并起，所以光武不避艰苦，经营河北。现在英俊云集，百姓风靡，虽然像邠、岐归古公父，也不足以比喻。你李轶如果能觉悟成败，及时确定大计，也像微子项伯一样论功成业，转祸为福，就在此时了。如果等到猛将们长驱直入，严厉的兵众把城围了起来，虽然悔恨，也来不及了。”
李轶接到信之后，非常矛盾，他知道更始政权已经走向灭亡了，但是因为自己背叛了刘氏兄弟，还是杀害刘縯的主谋之一，害怕刘秀不会原谅自己，所以不敢投降。
思前想后，李轶给冯异回了一封信，他在信中说：“我本来就是与萧王(刘秀)一起，首谋起义，志在复兴汉室。如今我奉命镇守洛阳，冯将军镇守孟津，都占据了中原的关隘要口，这是千载难逢的机会啊!我愿意和冯将军合作共事，我们双方只要同心同德、计划周密，将会无往而不胜。请您把我的计划转告给萧王，我愿意竭尽全力，佐国安民。”
李轶自从与冯异接洽后，再也不出兵与冯异作战。对各地的告急文书，一律按下，置之不理，坐拥大军三十万于洛阳，不发一卒以驰援各地。冯异腾出兵力之后，在黄河南北接连攻拔城池，招降更始守军十余万，接着又把更始朝廷的河南太守武勃包围在士乡县，武勃派人火速向洛阳的李轶求援。而李轶闭门不救，置之不理。最终，李轶坐视武勃的军队被冯异彻底消灭。而且，武勃本人也被冯异杀掉。
丧命洛阳
冯异看到李轶信守诺言，确实有归顺之意，急忙派人飞骑千里送信，向刘秀禀报战局详情。
刘秀知道此事之后，没有准备接纳李轶投降，反而想把李轶的书信故意泄露出去，让朱鲔知道，利用朱鲔的刀为大哥刘縯报仇。于是，他马上给冯异下令：“李季文为人奸诈，他的话一般人不能得其要领。我们应该把他的信公开，告诉各地的太守、都尉作为警备之用。”冯异不敢违抗，只好照办。他将李轶给自己信制成公文，向各地宣布说：这是舞阴王的来函，他表面上愿意归顺萧王，实际上却居心叵测，请诸位小心防范!一时之间，李轶给冯异的密函成了公开信，在黄河南北各地广为流传。朱鲔得知此事之后，非常愤怒，马上派人将李轶刺死。