演义上说马超是报父仇，来反对曹操。小说中写道：马腾领着西凉兵马，将次近城，只见前面一簇红旗，打着丞相旗号，马腾只道曹操自来点军，拍马向前。忽听得一声炮响，红旗开处，弓弩齐发。一将当先，乃曹洪也。马腾急拨马回时，两下喊声又起：左边许褚杀来，右边夏侯渊杀来，后面又是徐晃领兵杀至，截断西凉军马，将马腾父子三人困在垓心。马腾见不是头，奋力冲杀。马铁早被乱箭射死。马休随着马腾，左冲右突，不能得出。二人身带重伤，坐下马又被箭射倒。父子二人俱被执。曹操教将黄奎与马腾父子，一齐绑至。黄奎大叫：“无罪!”操教苗泽对证。马腾大骂曰：“竖儒误我大事!我不能为国杀贼，是乃天也!”操命牵出。马腾骂不绝口，与其子马休，及黄奎，一同遇害，然后马超报仇雪恨，挑起反抗曹操的大旗。
正史上却是这样写道：曹操不听谏议，坚持派遣钟繇、夏侯渊率领军队，试图经过马超等凉州军阀的领地进攻汉中的张鲁。马超等人都怀疑这是针对自己用兵，于是马超对韩遂说：“之前司隶校尉钟繇曾命我谋害将军，关东之人已经不可以相信了。现在我放弃我的父亲，如父亲一样对待将军，将军也应该放弃你的儿子，如儿子一样对待我。”
韩遂部下阎行进谏韩遂，不希望他与马超联合，韩遂回答：“现在诸将不谋而合，似乎有天意啊。”最终韩遂决意与马超等多位军阀起兵反曹，率领十万人马(包括汉兵、羌兵、胡兵)进逼至潼关。曹操使用离间计，令马、韩内讧，加上曹操战术成功，马超大败逃亡。曹操想乘胜追击，不过因田银、苏伯于河间作反，所以退兵。
但留在邺城的马超父亲马腾及家人却因马超起兵，为曹操所杀，马超临死时，也很悲惨，悲惨的对刘备说：“臣宗族门下二百口人，被曹操诛杀殆尽，只剩下从弟马岱，当以我卑微的宗族让他继承，深深地托付给陛下您，其他的也没什么话了。”
可见马超的父亲是因为自己反曹而害死的，当时对马超颇多微词：杨阜说：“马超背父叛君，虐杀州将，岂独阜之忧责，一州士大夫皆蒙其耻。”张鲁的部下也说：“张鲁部下：“有人若此不爱其亲，焉能爱人?”著名评论家孙盛也说：“是以周、郑交恶，汉高请羹，隗嚣捐子，马超背父，其为酷忍如此之极也。”姜叙的母亲破口大骂：“你背父之逆子，杀君(韦康)之桀贼，天地岂久容你，而不早死，敢以面目视人乎!”因此最坑爹的母亲莫过于马超。”