东林党和阉党其实没有什么本质上的区别，就像现在两党制国家的两个政党一样，你可以说他们都不是什么好鸟，但绝对没有谁是谁非这样的区别，两个政治组织而已。
东林党代表文官，阉党代表了皇权，明代相权皇权争斗的很厉害，皇帝都是依靠所谓的阉党(其实就是领头的是几个太监，多数也是文官)来制衡，这样平衡了权利，使国家多少能保持稳定。所以阉党在明代并不是洪水猛兽，不像汉唐不但把持朝政，还能决定皇帝的废立，只是一个维持权利平衡的政治集团而已。
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只是我们看到的历史都是由文官写就的，东林党当然被包装成一身正气的高尚人物，对于阉党也就无限贬低了，所以我们看到的阉党都是一群不男不女的老妖怪，杀人不眨眼，手段残忍，而东林党都是经受种种折磨，不屈不挠，最后终于获得胜利的悲剧式的英雄人物。其实就是政治斗争而已，而中国的政治斗争历来都是残酷的、不死不休的，阉党手段残忍，东林党也好不到哪里去。
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崇祯上台的确想做点事情挽救危亡的，但是入手点找错了，他认为国家变成这样就是因为朝廷醉心于党争而没人干实事，其实因为有党争，形成了互相制衡和监督，多少还能干点实事。他一上来就把阉党给一锅端了(这也从另一面说明明代根本没什么宦官专权，只要皇帝一发话，再牛的太监也立马完蛋)，再加上文官和皇权本身就是对立的，而崇祯等于主动放弃了皇权，东林党失去制衡后更加肆无忌惮，皇帝连帮他办事的人都没了，这帮文官更加不鸟皇帝了。
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崇祯清除了阉党后，以为能朝政清明了，结果发现东林党这帮人比起阉党有过之而无不及，而且再没有能和他们抗衡的人了。都说崇祯急躁而多疑，内阁换过几十个，大臣也杀了不少，其实崇祯也是挺无奈的，在位的大臣不听他的，他除了让他们去死或者滚蛋外没任何办法，但是换上来大臣也一个样，只能再杀或者再混蛋，陷入了这样的恶性循环，大明朝灭亡也就在情理之中了。
虽然一个朝代的兴亡有其深刻的历史规律在里面，但是像崇祯这样以简单粗暴的方法草率的打破朝政的平衡，又没有有效的补救手段，最后弄的不可收拾，客观上也加速了一个朝代的灭亡。