明宪宗朱见深即帝位时十七岁，正是青春年少的时候。两宫太后为替新皇帝选择皇后人选颇费了一番心思。她们在英宗生前亲自替儿子选定的十二名淑女中，再行认真挑选，选了王、吴、柏三人留住宫中，慢慢考察。
1464年七月二十日，明宪宗朱见深大婚。所谓大婚，专指皇帝的婚娶。朱见深当时婚娶的吴氏，是由父亲朱祁镇选定的。吴氏聪敏知书，通晓礼乐，是一个才貌双全的女子。
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皇帝的婚事，自然是隆重的。但是，仅仅还不到一个月，吴皇后就被废。取而代之的是王氏，即后来的孝贞皇后。
吴氏被废背后的缘由，一直为人所猜疑。一种说法是太监牛玉专恣，讨厌太监牛玉的人想借机夺去他的权柄，故挑动皇帝废后。皇帝自己的说法是吴皇后“举动轻佻，礼度率略”，且可能在册立时牛玉有舞弊的嫌疑。然而，吴氏虽被废，但“舞弊”的牛玉却只是发配到南京的孝陵去种菜。迂腐的官员以为牛玉真是犯有欺君之罪，于是纷纷上疏说对牛玉的惩罚太轻。结果，朱见深将上疏的官员王徽、王渊、朱宽、李翱、李钧贬到边远的州去做专管刑狱的判官。因此，“牛玉舞弊”的说法其实是不成立的。真正的原因是吴皇后得罪了皇帝宠爱的万氏。
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明宪宗大婚之后，年轻美貌的吴皇后并没有打动宪宗，他依然与万贞儿如漆似胶，常常宿在嫔妃万氏宫中，形影不离。对吴皇后不闻不问，这使吴皇后又气又羞。她不明白，自己哪一点比不上徐娘半老的万妃，无论姿色才学还是门第修养?她更不明白的是，比皇帝年龄大十七岁的万妃用什么手段把皇帝的心死死住?吴皇后便把这一切归结到了万贞儿身上，对万贞儿动用了杖刑，打的万贞儿站立不起。
吴皇后对万贵妃十分气恼，最后她以后宫之主的身份杖责万氏。皇帝获悉此事，便毫不犹豫地废了吴皇后。继立的王皇后，自然从中吸取了教训，对万氏的态度比较友善，不大理会万氏的横行霸道。王皇后的明哲保身态度，以及皇帝对万氏的宠幸，使万氏成为成化朝后宫真正的主人。
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成化四年(1468年)秋，出现了几次彗星。在古代，彗星的出现意味着不祥。于是，大学士彭时、尚书姚夔也上疏请求皇帝要扩大宠幸的范围，以广后嗣。皇帝表面上同意，但行动中仍然专幸万氏。所以，万氏在宫中越发地骄横起来。太监中谁违背了她的意思，就立即被赶出宫去。宫中的妇女一旦谁与皇帝发生关系并且怀孕的话，就千方百计命人进药汤，使其堕胎。贤妃柏氏生下一子，即悼恭太子，也为万氏所害。后来的明孝宗，若不是宫中的宫女、太监、废后吴氏、周太后的百般保全，恐怕也遭了万贵妃的毒手。但是，即使这样，宪宗朱见深对于万氏一直非常有感情。成化二十三年(1487年)春，万氏暴病身亡。宪宗非常伤感，哀叹说：“万氏长去了，我亦将去矣!”辍朝七天，谥万氏为恭肃端慎荣靖皇贵妃。
数月之后，宪宗皇帝悲伤过度而亡，年41岁!