成吉思汗一生中共立了三道遗嘱，这三道遗嘱在很大程度上改变了中国近千年的格局，对大半个世界都有着很深的印象。
遗嘱一：对蒙古帝国的内部结构，以及欧洲和亚洲很多国家(尤其是元朝)的影响都非常深刻
当时有能力继承成吉思汗皇位的有四个人，分别是长子术赤、次子察合台、三子窝阔台和幼子拖雷。1227年，成吉思汗在征伐的途中病倒，意识到自己将不久于人世，于是派人将驻兵附近的窝阔台和拖雷喊到身边，郑重的立下了临终遗嘱。
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“吾儿，父殆至寿终矣。赖长生天之助力，吾已为汝等建此大帝国。自国之中央达于四方边极之地，皆有一年行程。设若汝等欲保其不致分解，则必同心御敌，一意为汝等之友朋增加富贵。汝等中应有一人承大位。吾死后，汝等应奉窝阔台为主，不得违我遗命。察合台不在侧，应使其勿生乱心。”
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遗嘱二：直接导致了西夏被灭、国都被屠，从此再未复苏
当年的西夏因拒绝协助成吉思汗西征，所以成吉思汗于1217年对其发动了第四次征夏战争。打到一半的时候成吉思汗已经患病，原本是打算撤兵的，但是西夏国不领情，反而还言语挑衅，这可把他气得不行，发誓一定要攻下西夏。
同年十一月，蒙古大军已经包围了当时西夏的都城兴庆府(即今宁夏银川)。被围了半年后，西夏皇帝扛不住了，乞求投降。当时的成吉思汗病情是越来越重，都是被西夏给气的，想投降，哪能那么便宜的就放过他，决定彻底的把他们消灭干净才能解心头之恨，但是自己却是不能亲自做到。
于是他留下了第二道遗嘱：一方面令部属隐瞒自己的死讯，使西夏人不再改变投降的主意，使其国王亲自来到蒙古大军的营帐;另一方面，他又密令，要将他们全部斩尽杀绝，作为自己遗体前的祭品。
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遗嘱三：为蒙古灭金伐宋定下了基本方略，而在这个方略的指导下，他的后人也的确完成了这一宏图伟业
第三道遗嘱见于《元史》的记载。成吉思汗临死前对左右说道：“金精兵在潼关，南据连山，北限大河，难以遽破。若假道于宋，宋、金世仇，必能许我，则下兵唐、邓，直捣大梁。金急，必征兵潼关。然以数万之众，千里赴援，人马疲弊，虽至弗能战，破之必矣。”说完就死了，终年66岁。
这展现了他卓越的军事谋略，竟然能在弥留之际如此清晰地说出一个关系着蒙古、金、南宋三个大国的生死存亡的作战方略，就连出兵的路线都给规划好了，实在是让人佩服。