咸丰帝热河驾崩后，由他当时唯一的一个年仅6岁的儿子载淳继承大位，年号同治，第二年(1862年)为同治元年。
同治即位后，尊封咸丰帝的皇后钮祜禄氏为“母后皇太后”，徽号“慈安”;尊封自己的生母、贵妃叶赫那拉氏为“圣母皇太后”，徽号“慈禧”。由于慈安居于东宫，慈禧居西宫，历史上又将其称为东、西太后。
早在咸丰驾崩前的弥留之际，就意识到在他死后，这两个已是皇后和贵妃身份的女人，尤其是叶赫那拉氏，可能会闹出违背祖制的响声来。为了遏制这两个女人干预朝政，咸丰特别在遗诏中宣布，由肃顺等八大臣顾命，以辅佐年幼的皇帝。但令这位先皇出乎意料的是，看上去颇有些自命不凡的肃顺等八大臣，在权力的争夺中，竟一夜间被两个女人击垮，朝中的大权最终还是落在了东、西二宫之手。自此，大清的朝堂上，两宫皇太后开始了以皇帝的名义行使太后职权的“垂帘听政”。同治本人也开始了永无休止的作为傀儡皇帝的政治生涯。
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早在咸丰驾崩前的弥留之际，就意识到在他死后，这两个已是皇后和贵妃身份的女人
按照清朝祖制，历代皇帝都是登基后即选陵址、建陵寝，同治登基自然不能例外。但令人费解的怪异事情又出来了，同治当了十几年的皇帝，两宫太后却一直不开口提修建陵寝一事。太后没有恩准，作为傀儡皇帝的同治自然不敢吭声。
同治十三年(1875年)十二月初五日酉刻，同治因染上梅毒而撒手人寰，年仅19岁。
同治驾崩后，由于无嗣继位，便由慈禧做主，将慈禧胞妹的儿子、同治的堂弟兼表弟、年仅3岁半的载接入宫中，并很快让其继承大位，年号光绪，第二年(1876年)改元光绪。
光绪继位后，同治的皇后阿鲁特氏，因慈禧的专横暴虐而深感自己以后处境危艰，前程渺茫，遂于同治去世之后的光绪元年二月二十日，在宫中吞金自杀，卒年22岁。皇后自杀，举朝皆惊，无不为之扼腕痛惜。
帝后先后崩亡，理应尽快归葬，但由于慈禧的专权，直到此时同治的陵寝尚未建造，帝后的梓宫只好移奉隆福寺暂安
同治当了十几年的皇帝，两宫太后却一直不开口提修建陵寝一事
由于此前的咸丰帝已葬于东陵，按照清廷祖制，作为儿子的同治理应葬于西陵。但这时权柄在握的慈禧却偏偏不理祖宗那一套规制，反而大行逆道，断然决定在东陵的双山峪为同治建陵。
光绪元年八月，同治的惠陵开始在双山峪动工兴建，到光绪四年九月建成，建造工程仅用了三年零一个月的时间。在整个清东陵的皇帝陵寝中，这座陵寝不仅建造时间最短，就其整体规格和质量而言，也是最为低下和次劣的。清东陵五座皇帝陵寝中的最后一座陵寝，就这样匆匆收场了。
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光绪五年三月二十六日，同治帝、后的梓宫在停放了5年之后，被一同葬入东陵界内的惠陵地宫。
六十年后的1945年，同治帝后的惠陵被盗掘，皇帝的尸骨被捣毁，而完好如初，身体仍富弹性的皇后阿鲁特氏，衣服被剥光，腹部被剖开，肠子流淌了一地。盗墓者如此惨无人道的做法，竟是为了要得到当年皇后吞于腹中并被致于死命的一点点黄金。上帝无眼，苍天不公，一对生前境遇悲惨的男女，又突遭罹难，实在让后来者欲恨不能，欲哭无泪，为人世竟有这么多的不幸而悲天长悯!同治帝载淳，咸丰和慈禧之子，清朝第10代皇帝。6岁登上皇位，18岁开始亲政，亲政仅一年多，19岁便病死宫中。同治帝英年早逝，关于其病情和死因，历来说法不一。官书记载同治帝死于天花，民间却一直流传着同治帝死于梅毒的说法。对于当时的种种传言，清朝官方一直保持缄默，不予回应。近日，复旦大学历史系教授沈渭滨从《翁同龢日记》找到了更多的证据，证明同治是“走马牙疳”而死(是一种较危重的急性口腔病)。对于沈渭滨教授的研究成果，历史学、档案学、医学史的研究者又是怎么看的?
同治帝到底是不是死于梅毒?同治御医的后人和专家的观点并不一致。
民间长期以来一直流传着同治帝死于梅毒的种种故事。着名历史学家萧一山在他1923年所着的《清代通史》里，也再三强调了同治帝就是死于梅毒。另外，同治皇帝主治御医李德立的两位曾孙李镇和李志绥分别撰文称，祖上口传秘闻，同治帝死于梅毒。
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据李镇的解释，其实李德立一开始就已看出是梅毒之症，为了慎重起见还约另外一名外科御医会诊，两人一致肯定是梅毒。但李德立并没有奏明同治的生母慈禧，因为如实禀报有辱九五之尊，必遭杀身之祸，而知情不报隐瞒病情，也难免治罪。于是他假装糊涂，既然宫中都说天子出水痘，就照天花来治。对于李镇的解释，李德立的另一个曾孙李志绥则是另一种说法，当慈禧听到李德立的诊断结果后，强迫他宣布是天花，而且要用天花的方法医治，最终因药不对症才导致同治死亡。