从顺治三年(1646)到光绪三十年(1904)的258年中，清朝共取中状元114名，王朝300年只有一名状元的女儿有幸坐着凤舆，堂堂正正地进入大清门，抬进了坤宁宫，成了母仪天下的中宫皇后。这位状元就是大清“立国二百数十年，满、蒙人试汉文”惟一获得状元桂冠的蒙古状元崇绮。这位状元的女儿就是后来被谥为“孝哲毅皇后”的阿鲁特氏。
1872年，同治准备成婚时对于皇后的人选，两宫太后出现了分歧：慈安皇太后喜欢侍讲崇绮的女儿阿鲁特氏，慈禧皇太后则喜欢员外郎凤秀的女儿富察氏。争执不下意见不一，要同治自个选。同治选定崇绮的女儿阿鲁特氏。于是奉两宫皇太后懿旨，同治十一年(1872年)九月大婚，册立阿鲁特氏为皇后，同治17岁，皇后19岁。又册富察氏为慧妃。
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同治帝很喜爱这位出身名门的皇后。可是慈禧皇太后不喜欢这个儿媳妇，常常找茬难为她。甚至以“扰皇帝学业”为由不许她与同治皇帝同房，要同治对慧妃好。同治帝不敢违抗，只好赌气独宿养心殿，生活寂寞寡欢。而皇后阿鲁特氏每每见皇帝笑脸相迎，慈禧太后竟说她：“狐媚以惑主”
据野史记载：同治帝在深宫中颇感烦闷，于是通过身边的太监等时常出入宫禁，周旋于花街柳巷。同治十三年(1874)十月二十一日突然高热不退，下体红肿，遍体起红疹，太医们全体出动却素手无策，因为皇帝得的是不治之症：梅毒。同治帝有病，阿鲁特氏心中着急，但不敢去侍奉，慈禧责怪她“妖婢无夫妇情”。同治病势垂危之际，阿鲁特氏偷着去看望，并亲手为同治帝擦拭脓血，慈禧又骂她“妖婢，此时尔犹狐媚，必欲死尔夫耶?”
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据《崇陵传信录》载，一次阿鲁特氏去探望同治帝，夫妻俩互诉衷肠。同治帝安慰她说：“卿暂忍耐，终有出头日也。”这话被宫人传到慈禧耳朵里，她勃然大怒，到同治病榻前抓住阿鲁特氏的头发，边打边往外拽，并扬言要备大杖伺候。病床上的同治帝欲救不能，眼睁睁看着皇后惨遭凌辱，又急又气又害怕，竟昏了过去。慈禧这才饶了阿鲁特氏。
另根据《道咸以来朝野杂记》记载：太后要废后，于是将担任宗人府宗令敦亲王奕譞召来，商议此事。敦亲王说：“欲废后，非由大清门入者不能废大清门入之人，奴才不敢奉命。”慈禧欲废阿鲁特氏之心才作罢，但慈禧太后自己便不是大清门抬进来的，咸丰帝死前也没给慈禧皇后之位，未从大清门入不得皇后之尊，哪怕已贵为皇太后这是也她一生心里最大的坎。自此，她尤为痛恨阿鲁特氏。
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1875年1月12日同治皇帝死的时候，皇后大恸大悲，整日啼哭不思饮食，慈禧太后得到奏报说“可随大行皇帝去罢!”皇帝死了让她随夫殉死。而且慈禧不为同治立嗣，却让同治堂弟兼姨表弟载湉继承皇位，新皇称她为皇嫂，她也不是皇太后。这在有清一代也是闻所未闻的事。等于没有给她任何其他余地，唯有自尽一条路可走。光绪元年(1875年)二月，同治帝死后75天，皇后阿鲁特氏“遽尔崩逝”，年二十二。
野史有一说法：慈禧知道阿鲁特氏怀了孕，怕生了皇子，阿鲁特氏就成了皇太后，她就不能垂帘听政了。
1945年，同治帝后的惠陵被盗掘，皇帝的尸骨被捣毁，而据说尸身保持完整的皇后阿鲁特氏，衣服被剥光，腹部被剖开，肠子流淌了一地。盗墓贼如此惨无人道的做法，竟是为了要得到当年皇后吞金自杀的那块黄金。这不得不让人感慨：这位苦命皇后红颜薄命，不仅生前备受虐待，死后也不得安宁。