张居正死后，受到万历皇帝的清算，不仅被抄家，尸体也被挖出来鞭尸，我们通常总是从万历的个人爱憎上寻找答案。总而言之，是因为当年张居正管束万历太狠，让万历内心充满怨恨，加上张居正对万历严格要求，自己却说一套做一套，这才让万历对他展开报复。但其实呢，这种说法并不正确。因为，在张居正死前，万历就已经掌握大权，但张居正还是正常死亡，且在他死后，还获得很多的荣誉。从这层意义上说，万历对张居正并没有过多私人怨恨。更重要的是，万历作为一个皇帝，绝不会让自己的个人情感来凌驾于利益之上。
换句话说，如果打击张居正，对自己不利，一个皇帝真会为了从前某些私人矛盾，就不遗余力的打击已死的张居正吗?显然不会。其次，明帝国是一个高度成熟的官僚社会，所以，官员势力再大，也无法对皇帝构成威胁，对此，我们只需要看看明朝所谓的权臣、权阉，都是让皇帝轻轻一挥手，就灰飞烟灭。所以，对于万历来说，他实在缺乏为维护权利而打击张居正的动机，更何况当时张居正已死，他完全没有必要这样做。
事实上，万历打击张居正，他才是最大的损失者。因为，万历打击张居正，就意味着张居正的改革将会被废除，同时也就意味着万历一年将损失近600万两白银的收入。
为什么这么说呢?因为，张居正变法的核心，就是在全国重新丈量土地，把那些地主权贵偷偷隐瞒的田地丈量出来。据说一共多丈量出1.8亿亩田地，按照明朝的税收政策来估算，这1.8亿亩田地，每年将给朝廷上交近600万两白银的税收。从这层意义上说，万历就算是看在钱的份上，也不应该打击张居正。事实上，不要说万历与张居正就是些私人矛盾，就算万历与张居正有深仇大恨，如果推崇张居正就可以让自己每年多收600万两白银，万历也会推崇张居正的。因为，死人是无害的，推崇一个死人，而能让自己获得好的名声，还能让自己获得这样巨大实利。你觉得，除了圣人和货真价实的傻子，谁会拒绝这样做呢?
也正因为此，在张居正生前，虽然万历早已经亲政，但他却仍然让张居正主导政事，甚至在张居正死后，万历还下令给予他众多极高的荣誉。但问题是，张居正的改革实在损害太多人的利益。因为，明帝国在册收税的田地，一直只有5.2亿亩;就因为出了个张居正，就凭空上升到7亿亩。这对皇帝来说，自然是一件好事，因为这意味着他每年可以多收近600万两白银的税收。但是，对于广大地主乡绅集团来说，就意味着他们每年要多交近600万两白银的税，你说他们会愿意吗?同时，对于广大地方官员来说，也意味着他们每年需要多收取600万两白银的税来交给朝廷，这不是增加他们的任务吗?同时，他们收黑钱的空间也会变小。
在这种背景下，他们就不断给万历上书，总而言之，张居正丈量的这个数字水分太大，都是些黑心肠的官员，为了讨好上司，不顾老百姓死活，以少报多的结果。再总而言之，如果您拿这种账本，要求我们向老百姓收税，我估计会逼死很多老百姓。所以，相关的税收任务，打死我们，我们也无法完成。当然，如果你非要我们往死逼老百姓，我们自然也无话可说。问题是，话说到这个份上，皇帝哪敢逼官员这样干呢?因为，这句话的潜台词，只要皇帝你不怕逼死老百姓，咱们就这样干。皇帝自然知道，官员这不是在恐吓他，因为你真敢继续逼他们，你就得承担逼死成千上万老百姓的罪责。
逼死成千上万的老百姓，也许是小事，万一把帝国弄得翻了船呢?在张居正还活着的时候，因为有张居正挡在最前面，万历所受到的冲击还是比较有限，所以他自然乐得躲在后面，总而言之，张先生你一定得顶住，只要你能顶住，帝国政府一年就会多收600万两白银。但在张居正死后，万历一个小皇帝，突然面对官僚集团排山倒海一样的反扑，自然感觉力不从心。因为，和整个官僚集团对抗，绝不是谁也敢做的。所以，在张居正死后几个月，万历帝就投降认输，他下诏否定了张居正清查土地的结果。而皇帝一打开这个口子，各种否定张居正的声音马上愈演愈烈。这一通折腾下来，曾被张居正打击的官员，都得到平反;曾积极阻挠张居正清查土地的官员，也都得到表彰;而那些曾积极帮着张居正清查土地的官员，自然都成为奸臣。至于张居正呢，自然是鼓破众人棰。