全面抗战爆发后，中共中央为开展华南地区的抗日斗争，特别是１９３９年１月广州失陷后，中共中央确定了开展华南游击战争的战略方针，并把工作重点放在东江、琼崖地区，在这两个地区开展了广泛的游击战争。华南抗日游击队粉碎敌人多次「扫荡」，开辟了多块抗日根据地，在华南敌后给日本侵略者及日伪军以沉重打击。
一、东江、珠江地区抗日游击战争的开展
从１９３８年开始，东江和珠江地区的各县纷纷建立游击队，不断打击敌人。
在东江地区，１９３９年底，第４战区第３游击挺进纵队新编大队和第２大队分别在坪山于和乌石岩建立了根据地。１９４０年１０月初，又开创大岭山抗日根据地和阳台山为中心的抗日根据地。１９４３年１月到１１月，东江地区的游击队共作战７９次多，歼灭日伪军１０００余人，缴获武器５００余件，部队发展到４０００余人，另有民兵近１０００人，对敌占广九铁路运输线冰上革命构成了威胁。为了进一步发展东江的敌后游击队，１９４３年１２月２日，广东人民抗日游击队改编为东江纵队，尔后，建立了以罗浮山为中心的抗日根据地。
在珠江地区中学时代之追艳记，从１９３８年以后，广州市郊游击第２支队与南顺特务中队不断打击敌人，威震珠江三角洲。１９４０年夏，又建立了以西海村为中心的抗日根据地。１９４３年，珠江地区抗日游击战争得到进一步发展，到年底，珠江指挥部巩固了五桂山抗日根据地，部队和民兵人数都有所增加。
二、海南岛琼崖抗日游击队
活动于琼崖地区的红军在１９３８年１０月接受国民政府改编为「广东民众抗日自卫团第１４独立队」，队长为冯白驹。１９３９年３月，中共琼崖特委将独立队改称为独立总队，发展到１４００余人。３月到６月，独立总队连续袭击日军。６月起日军对琼文地区进行了「扫荡」，总队主力一部则插入琼山、海口郊区活动，在琼山第一区建立游击队，打击日军。１０月下旬，总队对日军的重要据点那大进行围攻，攻下那大并俘获日伪中队８０余人。
１９４０年１月２５日，琼崖特委及独立总队领导机关开始西移，于２月中旬到达美合地区。在该地区积极发动合组织群众，组织「农民抗日救国会」、「青抗会」、「妇救会」等民众团体。又使美合周围各乡１００多名青年加入独立总队，还在其他乡村建立自卫队。到１９４０年冬，独立总队已经发展到３０００余人，枪２０００余支，活动遍及琼山、文昌、澄迈、临高等１１个县，建立了琼文平原根据地、美合山区根据地和六连岭根据地等小块游击根据地。独立总队已经成为琼崖抗日的主要力量。
１９４３年１月，总结了敌人大规模长时间的扫荡特点，琼崖特委及独立总队作出了「坚持内线，挺进外线」的决策。第１支队向西挺进，在儒万山建立了抗日根据地。第２支队第１大队和琼山基干大队扩大琼东南抗日根据地。后又转战数月，逐渐恢复了琼文抗日根据地，开辟了万宁、陵水、和保亭广大游击区，创建并巩固了绿现山、儒万山抗日根据地，将各抗日游击根据地连成一片，部队也得到发展。