1942年冬，侵占南京的日本侵略军高森部队，准备在郊外建飞机场时，发现一座荧光闪闪的古坟，日军立即进行挖掘。
不久就发现一石椁，石椁内藏一石函，石函两侧刻有文字，一面为：“大唐三藏大遍觉法师玄奘顶骨早因黄巢发塔今长干寺演化大师可政于长安传得于此葬之”;另一面为“玄奘法师顶骨塔初在天禧寺之东冈明洪武十九年迁于寺之南冈三塔之上”。
为了验证真假，五名原中央大学考古学专业的教授被日军“请”来，对石函进行考证，同时为严防消息泄露，日军禁止教授们与外界接触，还将挖掘的民工杀掉。
那么，这些舍利子真的是唐僧的吗?唐僧是在西安去世，为何安葬在南京呢?日军敢带走这些舍利吗?
唐僧，法名玄奘，唐代著名高僧，法相宗创始人，被尊称为“三藏法师”，俗称“唐僧”，与鸠摩罗什、真谛并称为中国佛教三大翻译家。
玄奘俗名陈祎，于602年出生于洛州缑氏(今河南洛阳偃师)。自幼年跟父亲学儒家典籍，父亲去世后，随长捷法师(玄奘二兄)入寺受学《法华经》、《维摩经》等。
唐武德五年(622年)，玄奘在成都受具足戒，之后他游历各地，参访名师，讲经说法。但玄奘师深感真谛等古德译著不完善，致使一些重要的理论问题有很大分歧，难以融合，就产生去印度求真经的意愿。
玄奘，于公元627年离开长安，开始西行。往返十七年，行程五万里，从印度取回非常丰富的梵筴佛典，共526筴、657部经卷。
回到长安后，玄奘法师受到太宗的热烈欢迎，还亲自为他建寺。
玄奘顶骨舍利供奉在“玄奘大师顶骨塔”里
之后，他又用二十年的时间从事翻译工作。
唐高宗麟德六年(664年)，玄奘圆寂。高宗获悉后，竟五天不上朝，认为大唐痛失国宝。
据文献记载，玄奘法师圆寂后，葬于西安兴教寺塔，唐末黄巢起义时遭盗而捐残。宋朝时，天禧寺和尚法政，在陕西终南山紫阁寺发现玄奘法师顶骨，迎请到南京天禧寺供奉。明太祖时，天禧寺更名为长干寺，玄奘顶骨舍利移至南岗，修三藏塔安置。至朱棣时，在长干寺原址上修建大报恩寺，于玄奘三藏塔前建三藏殿。清未遭太平军燹而毁。
1943年2月3日的《国民日报》率先披露日军盗挖唐僧舍利后，引起中国民众强烈不满，纷纷发出要求归还的呼声，要求汪精卫伪政府出面干预此事。
日军迫于舆论压力，23日出版由谷田阅次署名的《三藏塔遗址之发掘报告》，承认玄奘法师顶骨出土的事实。
之后，由伪外交部长兼文物保管委员会委员长褚民谊接受日军归还的文物，但日方私自留下其中一份。
玄奘法师顶骨舍利重见天日之后，几经曲折，终于回到国人手中。