丘处机道：“我恩师不是生来就做道士的。他少年时先学文，再练武，是一位纵横江湖的英雄好汉，只因愤恨金兵入侵，毁我田庐，杀我百姓，曾大举义旗，与金兵对敌，占城夺地，在中原建下了轰轰烈烈的一番事业。后来终以金兵势盛，先师连战连败，将士伤亡殆尽，这才愤而出家。那时他自称‘活死人’，接连几年，住在本山的一个古墓之中，不肯出墓门一步，意思是虽生犹死，不愿与金贼共居于青天之下。所谓不共戴天，就是这个意思了。” ——《神雕侠侣》第4回 在金庸的《射雕英雄传》和《神雕侠侣》两本小说里，全真教是一个非常重要的教派组织。在射雕年代，全真教是武林最富盛名的大教派，首任教主王重阳以“天下第一”的武功笑傲群雄；到了神雕年代，虽然全真教今不如昔，但以丘处机为首的“全真七子”，依然在江湖世界里具有崇高的声望，极少有人胆敢小觑。
在这两部小说里，全真教都是以一个亲宋爱国的教派面目出现的，虽然也出现了类似赵志敬这样通敌卖国的叛徒，但毕竟是少数，全真教的三代典型教主：王重阳、丘处机、尹志平，都是忠肝义胆、爱国爱民的江湖豪杰，他们在抵抗金国、蒙古的先后入侵中，起到了极其重要的先锋带头作用，是南宋小朝廷的北方屏障。 然而历史上的王重阳、丘处机、尹志平三代教主，却和小说有着极其巨大的差异性：在他们执掌全真教的一生中，亲金元而远南宋，毕生服务于异族政权而毫无愧色。