抗战中期，贺耀祖曾在蒋介石的国民党军事委员会委员长侍从室担任要职，就在他担任侍从室第一处主任时，曾发生过一件蒋介石错批两份报告的事情，险些造成一起不小的冤案。
蒋介石平日里经常向部属吹嘘自己有超人的记忆力，每次侍从室呈送来的报告和文件，看完之后往往要等他休息够了再作批示。有一次，蒋介石上午看完报告，午睡后立即批了两份交贺耀祖办理，贺接过一看顿时傻了眼。原来，一份是请示惩办一个官员的报告，一份是侍从室一位亲随人员请批婚假的报告。谁知这个自诩记忆力惊人的蒋介石，竟来了个张冠李戴、阴阳颠倒：在请示惩处意见上批道“准假一星期”，而在请示婚假的报告上却批了 “执行枪决”几个字。贺耀祖再仔细一看报告内容，那个该惩处的人，按国民党的刑法也不至于判处死罪。
但是，贺耀祖深知蒋介石是个刚愎自用、听不进反对意见的人，如果马上去找他，只会自讨没趣，甚至招来麻烦。可照着批示去办吧，白己良心上又有点过不去。于是只好找了个理由失将请假结婚的人暂时送到军法处关押起来，以便日后相机行事。
过了几天，蒋介石传贺耀祖交办公事，贺耀祖一看蒋此刻心情高兴，便把两份报告呈上，请他过目，并小心翼翼地阐述了自己的看法。蒋介石看到自己错得实在太离谱，怕惹出笑话，影响自己的威信，于是立即下令释放那位未入洞房先进了牢房的亲随;而那个该判罪的官员也因此免了死刑。
蒋介石批阅公文还留下了一些趣闻。抗战胜利后，有部属呈上《抗战胜利之建军计划》一文。蒋先生看到这洋洋数万言、内容冗长的文章，在附件上提笔批道：“我非字纸篓。”
又有一次，某部长要送文呈蒋先生，因时间紧，来不及在公文上签名，只盖上自己私章。私章是用“钟鼎文”刻写的，其形状好像一条鱼，蒋先生端详半天，竟认不出是什么名字。于是，他只好在图章上写了这么一句：“我非考古家”以引起注意。