秦穆公墓位于凤翔县城东大街毡匠巷南端。秦穆公，秦国历史上一位有作为的君主，从公元前659年即位后，内修国政，外图霸业，扩张疆土，国势逐渐强大，一举成了春秋五霸之一。秦穆公在位39年，公元前621年下世。汉晋之后，历代在此勒石立碑，栽松植柏，岁时祭祀，渐成规模。基墓保留至今,成为人们瞻仰怀旧的圣迹。
早年，墓园占地约0.667公顷；墓冢在园内中心部位，坟丘呈覆斗型高约5～6米；墓区有大面积夯土和先秦瓦片堆积。民国末，陵园被附近农户辟为耕地。1956年，陕西省人民委员会将秦穆公墓列为省级重点文物保护单位。1982年，政府收回墓地附近被耕种的土地，在墓地四周筑起围墙，并重建陵园。现园内绿草成茵，松柏葱郁；仿古大门外竖有清乾隆四十一年（1776年）陕西巡抚毕沅所书“秦穆公墓”碑，民国时凤翔县长毛炳文所立之碑，陕西省人民委员会及凤翔县人民政府所立石碑四通。
在秦穆公墓所在的陵园内，还有与雍城文管所合署的凤翔县博物馆，馆内有展室288平方米，收藏凤翔历代各类文物3000多件。新建的《秦人寻根——秦国雍城史迹展》陈列室，以近20年出土的先秦精品文物为主要题材，从遗址、墓葬、窖藏等三个方面反映了雍城时期秦国的政治、经济和文化。
春秋五霸之一的秦穆公死后安葬于何处？清代时，陕西巡抚毕沅就将今凤翔城内毡匠巷的一个大土堆定为“秦穆公墓”。然而，2008年陕西省最新考古工作成果表明，毕沅的“结论”是错误的，被人们叫了200多年的“秦穆公墓”名不符实，所谓的“秦穆公墓”其实是战国时期雍城城内靠近北城墙处的一座高台建筑的地基，我们被毕沅“忽悠”了200多年，真正的“秦穆公墓”具体在哪儿至今还是个谜。
位于陕西省凤翔县境内的“秦穆公坟”，是陕西省级重点文物保护单位之一，因清代陕西巡抚毕沅的题记而得名，但与考古学家掌握的秦国雍城遗址与秦公陵园的布局与特点，存在明显差别。
陕西省考古研究院秦国雍城遗址考古队队长田亚岐说，自上世纪80年代起，分布在凤翔县内南指挥、三岔等地的秦公陵园相继被发现，它们不但分布在雍城遗址之南，而且再次确认了秦人“平地起坟、不封不树”的埋葬制度。因此，学者对所谓的“秦穆公坟”性质颇多怀疑。陕西省考古研究院院长焦南峰说，经过考古人员的实地调查与勘探，发现所谓“秦穆公坟”只是秦国雍城城内靠近北城墙的一座高台建筑。这座夯土高台是正方体的内收台阶结构，与秦国其时众多的高台建筑相一致，2008年时，所知其底座边长为38米。由于千年的风雨剥蚀，这个建筑真实的台阶数目及台高不清楚，其性质可能是礼仪性建筑或登高休闲类建筑。
专家认为，这一考古发现为研究战国时期建筑形制，尤其是确定秦国雍城遗址范围、进行大遗址保护与研究等，提供了重要资料，同时也提出了确认秦穆公陵园的难题。
至于秦穆公到底埋在何处？田亚岐说，自1976年至今，已在秦公陵园内发现了49座大墓，但这49座大墓中有没有秦穆公的墓？尚待进一步的考古发现予以确认。