95年），几年前，当蓝玉赠马时，大约朱棣还没养成后来的老谋深算，否则他大可假装高兴接受蓝玉的馈赠，然后以其不尊君父、私交藩王为词，背后狠参他一本，才够蓝玉吃一壶的呢！
不管怎样，朱棣以“尊君父”这样冠冕堂皇的理由拒绝蓝玉的好意，令蓝玉非常难堪；而且他也听出来，朱棣的语气里暗含着严重的指控。据夏燮《明通鉴》所记，蓝玉回朝后在太子跟前搬弄是非，说“臣观燕王在国，阴有不臣心。”太子听信了蓝玉的谗言，对燕王颇有微词，被朱棣知道了，更加记恨蓝玉。
这段记载大约出自夏燮的推测之词，但他洞穿了朱棣与蓝玉之间复杂关系的本质：蓝玉是太子一党，自然令燕王深恶痛绝，不仅存心给他小鞋穿，机会到了，还必欲除之而后快。
洪武二十五年（1392年）夏，太子朱标去世，蓝玉的后台垮了。朱棣来朝为兄奔丧，即在刚刚痛失爱子的老父面前大讲勋臣的坏话，说“诸公侯纵恣不法，将有尾大不掉之忧”。朱元璋深感孤立，由是越发疑忌功臣，于是“不数月而（蓝）玉祸作”，“列侯以下坐党夷灭者不可胜数”。
大概朱棣是以“蓝玉可忧”为话柄来进言的，因为蓝玉是洪武后期最为重要的将领，也是所存国公中唯一还握兵出征，并在军中拥有广泛影响力的勋臣。拿他开刀，并由他牵引进旁人，最后一锅端，应是对功臣下手的不二法门。
在《逆臣录》里，记载蓝玉曾放过一句狂言：“我不堪做太师耶？”《逆臣录》没有交代前因后果，而《明史·蓝玉传》将此事放在洪武二十五年蓝玉西征还京后。此次出征，蓝玉又获大捷，朝廷给他加官太子太傅，他却嫌官小，抱怨道：“我征西征北受了多少辛苦，如今取我回来，只道封我做太师，却着我做太傅，太师倒着别人做了！”
太师应是太子太师的省称，宋国公冯胜、颍国公傅友德做的正是太子太师，显然蓝玉是表示不服老一辈英雄冯、傅二人，不甘位居其砮皂的价码下。可是挟大功而还、心高气傲的蓝玉，并没有巩固主上的信任，反而加剧了对他的猜忌，朱元璋经常故意驳回他的一些建议，让他很没面子。
朱元璋就是要让蓝玉当众出丑！他的逻辑是，蓝玉有大功，回朝后却没有得到相应的奖赏，相反还有失宠的迹象，他一定会怏怏不乐，暗怀对朝廷的不满，久之必将不利于朝廷。这是朱元璋为蓝玉铺下的一条谋反之路，在这条路前方不知什么地方，他已为蓝玉安设好了一只巨大的捕兽夹。
在《逆臣录》里，众多的“蓝党”供词印证了朱元璋对蓝玉“心路历程”的判断；据蓝党供述，蓝玉对朝廷是既不满，又不安，这些年来，为了“胡党”的事，公侯一家家被废，使他产生了强烈的危机感，而最近他的亲家靖宁侯叶升又出事了，担心招出他也是胡党，因此犯下疑心病，他常对部下说：“只怕早晚也容我不过，不如趁早下手做一场。”心怀不满，又感觉大难临头的蓝玉，准备豁出去干一场，于是约同诸将，打算趁朱元璋出都城举行藉田礼时下手谋反。
以上便是《逆臣录》提供的蓝玉谋反“路线图”。当然啦，全出于“逼供信”，其可信之度数，比汽水的酒精度还低。
好比供词中那个所谓的“谋反计划”，最后只落得一个纸上谈兵，藉田礼都过期了，也未见实行。难道蓝大将军会只制定作战计划，而不懂得迅捷实施吗？
且说蓝玉未败之前的诸多不满，假如都是真的，却正好表明蓝玉无谋反之心。试想：一个想当皇帝的人，会斤斤计较是做太师还是做太傅？会因为一个虚衔，而不服老前辈冯胜、傅友德，平白为自己树敌？例如傅友德的加衔，亦不过太子太师，与太子太傅级别相同，都是从一品的宫衔，只是排序在前，上朝排班时稍占一些便宜而已。
（注：宫衔包括太子太师、太子太傅、太子太保及太子少师、太子少傅、太子少保，分别称为“东宫三师”，从一品，与“东宫三少”，正二品。他们是名义上的东宫辅导官，但并不在东宫任事，只是一种加衔）
我不信作为大将军的蓝玉，眼孔如此之小，城府气度如此之浅窄。况且，说他因为奏事言多不从，便心中怏怏，也不是确凿的证据，多半属于朱元璋神经病发作：故意驳人家，还怀疑被驳者心里不服，进而又猜人家会不会因为不服而造反。这是疯子的逻辑，没法跟他辩的。
反正后世是没人相信蓝玉谋反的，如《国榷》作者谈迁就说：“虎将粗暴，不善为容”，骄纵或有之，但“非反也”。至于蓝玉是否真如官史说的那么骄纵，无法无天，就很难考证了。
有人认为，太子朱标之死，是促成朱元璋下大决心，再次大兴屠戮的关键因素。为什么呢？因为新立的皇太孙朱允炆年纪尚幼，怕他无法驾驭群雄，所以决定在自己死之前，将随他打天下的英雄好汉们一起带走。然而此说不尽能成立，说太孙年幼，其实也不甚幼了，已经是二十多岁的小伙子，并且已经生子；朱元璋怕他驾驭不了群雄，可也没啥“雄”剩下了，除了蓝玉，冯、傅两位国公皆廉颇老矣，早已不再理事，而那些做侯、做伯的，多是些二三流人物，太祖担心他们闹事，实在有些多余。
有个故事讲：朱允炆见惨杀太甚，大为不忍，就劝谏祖父，少杀些人，为朝廷存些元气，也少一些戾气。朱元璋听了，默而不言，次日把允炆叫来，将一根长满荆棘的木杖扔在地上，命允炆拾起。见允炆面有难色，朱元璋才指着教具，细细开导他：“我杀人，就是为了削去杖上的棘刺，再交给你呀！”
这故事是上一种观点的具体化。
看官，是否有似曾相识之感？对，这故事已讲过一次了，只是上次的主角是太子朱标，这里换作了允炆。这个有鼻子有眼的故事，其实不过是后人编的一个寓言。试想，朱元璋在后宫进行这样的“铁血”教育，能不避人？怎么就被史官偷听到了？朱元璋即便讲过类似的话，他也不愿意这些密语被人听去记下来。
朱元璋在晚年无缘无故再兴惨杀，实在是不好解释的。但有一点是肯定的，即朱元璋这么做，加剧了朝廷空虚、外强内弱的状况，给未来皇太孙的统治，造成相当不利的形势。
坐蓝案而死者，有公侯、文武大吏，以及偏裨将卒“达二万人，蔓衍过于胡惟庸案”——“于是元功宿将相继尽矣”。至朱棣起兵夺位，朝廷没有大将好用，不得不起用当代赵括，只会纸上谈兵的纨绔公子李景隆，结果造成皇朝倾覆的大难。因此可以说，蓝玉党案在洪武晚年的爆发，朱棣是最大的受益者。因此有人深疑，蓝党之案，朱棣正是其幕后推波助澜的黑手。