唐朝历史上的玄武门兵变，一直被后人津津乐道。玄武兵之变，是李世民与其弟兄的决战，是一场骨肉相残，兄弟相杀的历史悲剧。在这场你死我活的兄弟相争之中，李世明麾下第一猛将的秦琼，却没有在玄武门之变中有突出表现，甚至都没有关于秦琼参加玄武门之变的多少记载？这是为什么呢？
历史上的秦琼是非常彪悍的，他本来是隋朝的将军，不过他跟随的张须陀将军最后战死沙场，所以他又投靠了裴仁基的部下，可是裴仁基又投靠李密，他又跟着李密一起讨伐王世充，结果李密又失败了，投降后跟了王世充，因为王世充的为人实在是让他看不惯，所以他和其他一些人归于了李唐，后来被分配到了李世民的营帐。
史书上说：秦琼随李世民，讨伐王世充、窦建德、刘黑闼，每战身先鏖战，前无坚对。每当对手阵营中有骁将锐士震烁出入以夸众者，秦王则名叔宝往取之，跃马挺枪刺于万众中，莫不如志。作为李世民盔下最骁勇善战的猛将，秦琼却没有参与到玄武门之变中，他的缺席让人匪夷所思。
在史书中我们找不到秦琼，积极帮助李世民谋划玄武门之变的记载。在《新唐书》中，秦琼和玄武门之变唯一的一段有关记载只有一句话，是说玄武门之变后，秦琼被赏赐了封邑七百户。这是因为秦琼在玄武门之战，表现突出的奖赏吗?
未必，因为那位玄武门之变中除了秦王之外的第一主力——尉迟敬德，在事变之后得到的封邑是一千三百户。比较有名的张公谨、侯君集得到的封邑是一千户，比秦叔宝多得多。《旧唐书》中说秦琼那天确实随从秦王到了玄武门。那么从封邑的多少，似乎不难判断出，公元626年的那个夏天，秦叔宝在玄武门事变中的表现和战场之上的勇猛无敌一定判若两人。
最大的可能是秦琼一定很不愿意搅入到这场为夺帝位的骨肉相争当中，所以表现失常。事实上，唐代早期最著名的军事将领李靖和李绩，对于李世民与太子建成的帝位之争都采取了严守中立的态度，不做任何政治投机。这使得李世民对他们更为敬重。而秦琼本身是秦王府的将领，在这场你死我活的帝位之争中，他不可能像二位李将军那样可以置身事外，保持中立。
他只能站在秦王一边。可是他一定知道，这场帝位之战一旦打响，那么长安城内，必定是血流成河，这样的杀戮和在战场之上百万军中取上将首级，完全不同。在这样的一场不是为了大唐，而是为了秦王帝王野心的血战中，秦琼选择了不参与，消极避战。
后来的凌烟阁二十四功臣中，秦琼排在最后一名，排名在尉迟恭和程咬金之后，按道理以秦琼的功劳，不进入三甲，也不会低于尉迟恭与程咬金。那么唯一的可能就是，秦琼没有掺和玄武门事变，而凌烟阁二十四功臣，基本是按照在玄武门的表现来排序的。